接达到武、赖伊和缪拉送来的大量陈述以后，在13日上午9点，拿破伦终究认识到全部普军已经向北转移。他当即向达武、拉纳、赖伊、吕内和贝纳多特公布连续串的号令，做幸亏耶拿决斗的筹办或是追击逃窜的普军。下午3点，正在向耶拿城进步的拿破伦接到拉纳的陈述，说法军已经占据耶拿城。拿破伦停止了最后的计谋摆设，决定将仍然处于魏玛四周和耶拿之间的普军主力一网打尽。
法军持续进步，拿破伦鉴定敌军主力会合结在吉拉，成果扑了个空，那边除了不到一千人的处所军队以外，连一个普鲁士的正规军也看不到。拿破伦号令缪拉的马队军团在前探路，达武的近卫军团也被抽调了来进军瑙姆堡，两翼由拉纳和赖伊带领。同时萧杰也获得号令将第88军团调集，筹办随时援助火线的战役。
“这个？详细安排我也不晓得，你还问一下总参谋长中间吧。”拿破伦把球踢给了贝尔蒂埃。
“陛下，我想问一下我的军团甚么时候能够投入战役。”萧杰问道。
下午两点霍恩洛厄认识到法军的力量远远超越了本身，因而号令向北撤退，朝魏玛方向逃窜。到下午3点，耶拿战役法军已经稳操胜券。一小时后，缪拉在通往魏玛的路上追击普军，赖伊的军团紧随厥后。他们不抓俘虏、不听告饶，见普军就杀，崩溃的普军大多成了法军的刀下之鬼。吕内也将普军的其他残部全数毁灭。
10月10日，拉纳元帅的第五军团逼近萨尔弗尔德城，与保卫该城的路德威格亲王的1万五千人敌军展开苦战，亲王寡不敌众在搏斗中死于法军的刺刀下，其部下逃往布伦瑞克公爵保护的魏玛或霍恩洛厄亲王保护的耶拿。法军的神速使普军批示官大为吃惊。他们没想到法军的打击会这么快，快得使他们来不及完成计谋摆设。
到12点30分时，拿破伦在火线的兵力已经达到8万多人，并且另有6万多人的后备力量，包含缪拉的马队军团与吕内的第四军团。下午一点整法军正式建议打击，拿破伦将第四军团和马队团全数投入战役。在打击之前，法军集合超越500门大炮对普军阵地停止了长达半个小时的炮击，普军死伤惨痛。在法军的狠恶炮击下很多普军都丧失了斗志。
从他的话中，萧杰第一次听出了一丝无法。看到本身的兵士不竭的在疆场上丧命，即便拿破伦这类经历惯了大风大浪的人还是很不忍心的，但这或许就是称霸必须支出的代价吧。