朱由校要集权，但没有要闭幕内阁的意义，毕竟他的才气、精力都是有限的，只得仿效太祖建立内阁制的初志：让内阁只要议政的权力，将决策权紧紧抓在手中，行政权归六部。
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平心而论，这类个人决策应当视为民主进步。但有民主必定会有分歧政见，进而构成各种政治权势，在现在这类内忧内乱的环境下，无疑会像本来的汗青一样使朝臣陷于站队、相互攻讦、减轻内哄的泥潭，反而没有集权来的高效。
朱由校登极以后便升杨涟为兵科都给事中（正七品，为兵科长官），对其信赖有加。厥后，杨涟因朝野思疑，上疏《移宫委曲》，经《京报》、邸报皆刊示曲直，朝野不再群情宫闱。
“皇上……”杨涟顷刻便想通了，这是让本身外出避风头，心中顷刻五味杂陈，俄然感受被人拽住衣袖，一看恰是左光斗在提示本身，忙叩首到，“臣，领旨。”
“皇上……”杨涟昂首见天子面色不愉，没有再持续。
“臣不敢。”
“左御史，你与阁臣同为臣子，分歧心济事，竟背公植党，疑诋辅臣，致伤国体？”
“猖獗，累朝列圣简置阁员，俱凭宸断，当时政务修明，切谏不乏，亦曾有如此抗阻否？何来私用之说？尔等以‘公义’威胁朕，还欲效仿李如柏之事？”
左光斗在来时，一起安慰杨涟留任，闻言也下跪道，“皇上，臣同魏应嘉、方孝孺都等皆觉得移宫之事，杨涟功在社稷，从无居功之心，乞皇上慰留以光言路。”
朱由校身为移宫的亲历者，在杨涟上《委曲》以后天然要表扬他，称其‘奸佞可嘉，志安社稷’，朝野却说杨涟此举居功邀宠，让他百口莫辩。
他接着想起了南下的魏进忠，不由苦笑不已。
“你代朕到各地逛逛，催促朕旨意获得实在履行，凡遇才不堪用、疏玩怠政、偷梁换柱、阳奉阴违者，密折参劾，朕必严惩，宁枉勿纵。”
如此，天子御批和内阁票拟的主次就不言自了然，朱由校既能看出揽主权与尊主权的一字之差，本色的权力归宿却天壤之别，就毫不会承诺。
神庙之以是让方从哲独支内阁，就是因为他听打整，能提他背黑锅；而孙如游入阁以后就上《朝条十事》，别离为保圣躬、勤圣学、揽主权、时召对、肃纪纲、挽世风、惜老成、延言路、饬边备、苏民困，此中揽主权一项，正中朱由校下怀。
朱由校皱眉道，“移宫之事，文武大小臣工所共见，朕亦已屡谕明白，各官辩论俱已有旨，是非自见，你烦言求去，使朕伶仃于上，岂是忠爱？”
朱由校听到前面传来的回应，内心却憋屈得紧，真想将定见分歧的人一个个都干掉。但是，他却不能那么做，不然身边将环绕的都是恭维阿谀之人。
“臣遵旨。”
朱由校看了看沉默不语的方从哲、孙如游后，板着脸走到杨涟面前，昂首看着这个四十出头的中年人，问道，“知朕为何让你伴驾到此吗？”
内阁轨制生长到现在，阁臣垂垂将决策权把持在手中，职位划一于宰相，已经能够压抑六部。在必然程度上，可制止天子的劳累和决策失误，有后代君宪制的意义。
左光斗还想辩论，见天子已经转正拜别，苦笑遥拜道，“臣领旨。”
杨涟不睬会左光斗，叩首道，“臣主移宫实因有选侍欲垂帘之暗害，继离出震之时，诸臣共有防微虑隐之意，臣不过从诸臣后，竭蹷号呼呼应和罢了。且皇上登极名正言顺，臣岂敢贪天为力。克日言论皆因臣起，心有不安，唯有决去以仰报皇上深恩。”