跟着能量炸弹的爆炸，联军主力也被联盟舰队完整毁灭。这场惨烈的胜利让联盟支出了沉重的代价，但也胜利化解了一次没顶之灾。
艾莉丝、卡修斯和瑞克斯再次投身战役，他们作为舰队的前锋，带领着各文明的精锐战舰，朝着联军能够埋没的星系进发。一起上，舰队遭受了联军的多次小范围攻击，但都仰仗着高超的战术和固执的意志胜利击退仇敌。
艾莉丝决定将计就计，让队员假装成暗盘构造成员，混入联军内部。在一次联军与暗盘构造的买卖中，他们胜利打入了联军的核心基地。基地内部防备森严，到处都是先进的防备设施和巡查兵士。艾莉丝等人操纵隐形装配和高超的潜行技能，逐步靠近能量研讨地区。
当舰队到达联军主力地点星系时，一场惊心动魄的星际大战发作了。两边的战舰在宇宙中交火，激光炮、导弹和能量兵器的光芒照亮了暗中的星空。联军仰仗着改革后的新能量兵器，一开端占有了上风，他们的进犯强大而狠恶，联盟舰队的护盾在其进犯下不竭闪动、分裂。
终究，在颠末一番存亡斗争后，他们胜利冲破了防备场，靠近了能量炸弹。艾莉丝和队员们操纵飞船上的统统兵器和能量装配，对能量炸弹策动了进犯。颠末持续不竭的进犯，能量炸弹的布局开端呈现不稳定迹象。
瑞克斯见状，毫不踌躇地冲向联军战舰，与之同归于尽。艾莉丝在哀思中，集合统统力量，终究胜利摧毁了能量炸弹。
但是，在靠近目标时，他们触发了联军的初级警报体系。刹时，全部基地灯火透明，警报声高文，兵士们从四周八方涌来。行动队堕入了绝境，只能抖擞抵当。卡修斯阐扬他超卓的射击技能，为队员们供应火力保护；瑞克斯则带领近身战役队员，与冲上来的仇敌展开狠恶斗争。
艾莉丝在联盟总部的科研中间，带领团队进一步深化新能量的研讨与利用拓展。他们试图将新能量与生物科技连络，开辟出能够加强生命体潜能的技术，但尝试停顿迟缓，且呈现了一些难以解释的非常征象。尝试样本在接管能量刺激后，基因呈现了不稳定的变异，部分乃至产生了狂暴且具有进犯性的行动偏向，这让艾莉丝深感忧愁。
艾莉丝在联盟舰队的批示舰上，密切存眷着疆场局势，不竭调剂战术。跟着战役的停止，联盟舰队逐步窜改结局势，联军的战舰一艘艘被摧毁或落空战役力。
联盟议会敏捷召开告急集会，参议应对战略。各方定见不一，部分文明主张主动反击，寻觅联军巢穴并予以摧毁；另一部分则建议加强边疆防备，等候机会。艾莉丝站出来提出，应先深切调查联军获得新能量技术的路子，以及他们改革后的能量特性，以便制定更有效的反击计划。议会终究采取了她的建议，调派艾莉丝带领一支由顶尖科学家、特工和兵士构成的特别行动队，奥妙潜入能够与联军有联络的星系展开调查。
在狠恶的战役中，瑞克斯带领着一支突击队，胜利冲破了联军的防地，登上了一艘联军旗舰。他们在舰内与仇敌展开了近身搏斗，颠末一番苦战，胜利摧毁了旗舰的批示体系，使联兵舰队堕入了混乱。
艾莉丝在混乱中持续向能量研讨地区进步，她发明联军对新能量的改革体例极其卤莽，通过一种伤害的能量紧缩和融会技术，极大地加强了能量的粉碎力，但也导致其极不稳定，随时能够激发灾害性的结果。她敏捷汇集相干数据，并试图寻觅粉碎研讨设施的体例，禁止联军进一步完美这类伤害技术。