与此同时，卡修斯带领的特种作战军队胜利潜入了仇敌的火线补给基地。他们奇妙地避开了仇敌的巡查军队，操纵高科技兵器对补给基地的关头设施停止了粉碎，激发了一系列的爆炸。补给基地的瘫痪使得联军的火线军队堕入了物质完善的窘境，极大地影响了他们的战役力。
但是，就在联盟主动备战的过程中，谍报部分传来了一个令人震惊的动静：外星种族与一个名为“暗影帝国”的险恶权势勾搭在了一起，构成了一个更增强大的联盟，筹办对宇宙文明联盟策动一场史无前例的总攻。暗影帝国以其善于藏匿行迹和策动俄然攻击而闻名，他们具有着一种能够扭曲空间的暗中能量技术，使得他们的战舰能够在刹时呈现在仇敌的火线，策动致命一击。
与此同时，联盟也主动展开交际活动，试图与其他宇宙权势建立更遍及的联盟干系。艾莉丝作为联盟的代表，多次前去其他星系与潜伏的盟友停止构和和交换。在这个过程中，她碰到了一个陈腐而奥秘的文明——星耀族。星耀族具有着高度发财的科技和奇特的文明，他们对宇宙的能量法例有着深切的了解。颠末一番艰巨的构和，星耀族终究同意与宇宙文明联盟建立计谋合作火伴干系，共同对抗外星种族和其他潜伏威胁。
当外星种族和暗影帝国联军浩浩大荡地向同盟国土进发时，他们涓滴没有发觉到本身已经堕入了联盟经心安插的圈套当中。联军的前锋军队起首进入了联盟设置的第一个伏击圈，刹时遭到了来自四周八方的进犯。联盟舰队操纵地形上风和先进的兵器设备，对外星种族和暗影帝国联军的前锋军队策动了狠恶的进犯，使其堕入了混乱。
在正面疆场上，艾莉丝带领的主力舰队与联军展开了狠恶的决斗。联盟舰队充分阐扬“量子扰频炮”和“星耀能源”兵器的上风，对外星种族和暗影帝国联军的战舰策动了一轮又一轮的进犯。固然联军也停止了固执的抵当，但在联盟舰队的强大守势下，逐步处于下风。
基于这一发明，科研团队胜利开辟出了“量子扰频炮”，这类兵器能够发射特别的能量脉冲，切确地滋扰外星种族能量核心的量子胶葛态，从而使其战舰落空动力或兵器体系见效。同时，为了晋升联盟战舰的防备才气，科学家们还研收回了“自适应能量护盾”，这类护盾能够按照敌方进犯的能量范例和频次，主动调剂本身的能量参数，实现更高效的防备。
面对这一严峻情势，联盟议会告急召开集会，参议应对之策。艾莉丝提出了一个全面的作战打算：操纵联盟的谍报收集，提早把握仇敌的打击线路和兵力摆设环境，然后在外星种族和暗影帝国联军的必经之路设置一系列的伏击圈和圈套，同时派出精锐军队对仇敌的火线补给线停止骚扰和粉碎，打乱他们的作战打算。
但是，暗影帝国的暗中能量技术也给联盟舰队带来了庞大的威胁。他们的战舰能够操纵暗中能量制造出强大的引力场，将联盟的战舰吸向本身，然后策动近间隔进犯。为了应对这一威胁，联盟舰队的科学家们告急研收回了“反引力护盾”，这类护盾能够有效地抵抗暗影帝国战舰的引力场进犯，为联盟舰队的反击缔造了前提。