崇祯听了才忽的想起，遂下诏：“令孙承宗当即进京。”当日晚，崇祯于平台召见孙承宗，二人长谈好久，并于第二日下诏“令孙承宗以原官任少师兼太子太师、吏部尚书、中极殿大学士改兼兵部尚书，驻通州控御东敌。”
十一月初四日，遵化沦陷，巡抚王元雅走入署衙引火他杀。初四日晚，皇太极率满洲右翼四旗至遵化与阿济格所部右翼四旗与蒙古军汇合，听闻袁崇焕驻守蓟镇，因为多次为袁崇焕所败不敢与其争锋，率军取道顺义、三河绕过通州，直奔北京。
孙承宗看着萧亦拜别，想了想，制止了随行人欲叫住的做法，道：“随他去吧，我观此人断不会是特工，立即前去通州，不成再当误了。”
“皇上，臣请杀袁崇焕！”议郎蔡中正突的大喊，除内阁首辅李标没有涓滴表态以外，厥后众臣皆匐跪，朝臣的定见竟惊人的分歧，一句话久久环抱在大殿之上‘臣等请杀袁崇焕！’