而一应女军们也在朝中设了官职，答应女子出任朝中官职，固然朝廷答应女子出任官职，但真正在朝廷任职的也只是琼英、孙二娘、庞秋霞、顾大嫂等跟从三娘起家的女将，很少有女子真正通过科举测验仕进的。直到厥后三娘之子扈宗明继位后的第五年上，才正式有第一名元朝女子正端庄经通过科举仕进的，到扈宗明即位十年后才呈现了第一名科举女状元，那都是二三十年以后的事了。
定下国号与都城以后，三娘改年号为宣武，以次年为宣武元年，册封鲁王世子扈宗明为太子。改宋朝官制，建立元朝官制，正式建立中书省总理政务，以太子扈宗明为中书令，而后中书令均由元朝皇太子兼领，定为虚衔。中书省长官，中书令以下，设左、右丞相为实任的宰相，以宗泽为左相，宿元景为右相。下设平章政事四员、摆布丞各一员、参知政事两员为副相，以李纲、黄裳、汪藻、杨时为平章政事，黄文炳为左丞，娄敏中为右丞，闻焕章、高俅为参知政事。
枢密院下设六部，与宋制不异，也普通的是吏部、工部、户部、礼部、刑部、兵部。每部尚书改成一员，每部侍郎改成六人，每部配属簿书、文吏、算官多少。
枢密院内还设参谋部、谍报司、水兵部三个关键部分。参谋部便是枢密院评价周边诸国气力，推演与假想敌作战方略，制定各种作战打算，编练天下军马之地。谍报司顾名思义便是汇集谍报的处所，谍报司是侧重军事谍报汇集，处于明面上的谍报机构，而锦衣卫始终是三娘亲身掌管的大内幕报机构，二者互不堆叠。水兵部便是掌管天下水兵的部分，编练天下水兵、内河水军，沿岸、沿河防务都属这个部分。
工部的职司除了之前的兴建水利、修桥铺路、营建屋宇、宫殿、城垣以外，三娘新设了火器司、船舶司、机器司三个司部。火器司就是卖力制造、研发各种火器、火炮、火药的司部，该司部早在山东路时就存在，当时的山东路的工匠们都被集合到一起，专门补葺火器和配制火药，现在只是正式挂牌罢了。船舶司也是在山东路时就有，卖力办理船只、制作船只。同时船舶司还要该管内河航运来往的各种船舶，也算是江海事局的前身。机器司卖力的事也很多，从矿产勘察到开采、冶炼，以及各种机器的制造等等。
同时三娘还设立了御史监察台，卖力监察天下官吏，设立了宗正府办理宗室以及各级爵位的公侯们，设立宣政院办理天下教义，设立了宣慰司卖力办理少数民族事件。而公孙胜、鲁智深、武松等削发人多被封了护国真人、国师等职位，便在宣政院内任职。
宋建炎元年蒲月，大宋北伐军班师陈桥驿，三大主将领全军十余万将士奏请天子禅位鲁王，宋朝最后一名天子，第一名女天子赵嬛嬛欣然应允，颁下禅位圣旨，祭告宗庙后，便将帝位传位鲁王扈岚。
扈元朝的中书省自中书令以下，实权人物共有十人，便是替天子掌控天下军政大事的中枢，中书省也被后代称为十人内阁，得入中书省的都顶着各殿大学士的名号，后为常例。
而兵部此次官制变动最惹人谛视标就是兵部之下设立的兵甲司和后勤司，这两个司部承担的职责便是把各军统军将领手中的权力剥了过来，赋税甲器一应军中所需此后由户部这两个司承担，就不再是一军将领掌控全军的赋税甲器了。这也是三娘早早的把制止部下将领坐大的手腕使了出来，只要节制住一军的赋税甲器命脉，再强的将领也不能掀起甚么风波来，这也意味着三娘对天下军队的节制更加松散了，此后军队便是国度的军队而不是哪一个将领的军队了。