育、卫生2个科及统计室。1937年9月张建调任军医黉舍教诲长，胡兰生接任署长。
2、大本营
第一部该部于1937年8月20日建立．掌作战。大本营第一号训令规定该部直接指导火线勤务部.任命黄绍竑为部长.11月13日部长易徐永昌，王俊、张定璠前后于9月11日和11月18日任副部长.12月27日任命王鸿韶为该部办公厅主任,1938年1月该部和参谋本部归并编成军令部
军法履行总监部，掌理军队规律之保持与军法履行事件.该部下分总务、审判和督察3个组：总务组，掌理该部文电收发．承办文书典守印信、编审预算及经费出纳并碎务和官兵起落开补功过、奖惩告假旷职等各项事项。审判组，并军政部军法司而建立，掌甲士犯法案件考核事项；非甲士犯汉奸、烟毒、盗匪、贪污及其他法律应归军法审判案件之审理、考核事项；关于军法法规检查事项；关于解答法律疑问事项；关于军事犯措置事项；关于该组禁闭人犯收管、戒保护生登记、访问查抄册本函件各事项；关于军法行政事项。督察组，掌前火线文武构造职员违背军事法律之事项；关于考查各级司令部军法处有无枉纵事项；关于消查各地汉奸活动加以制裁事项；关于考查军情战况、交通运输、防空保镳、救保护生及公众构造练习各事项.
建立后的军训部下辖机构大抵同原练习总监部。设有参事室，掌理关于法律章制之撰拟及交办事项，1938年2月任命徐
1937年8月11日gmd中心政治委员会第五十一次集会决定通过了《国防最高集会构造条例》，并送经gmd中心常务委员会第五十次集会决定通过.1937年11月中心常务委员会决定．将中心政治委员会之权柄暂行停止，由国防最高集会代行国防最高集会应设在军事委员会委员长地点地.1938年2月23日国防最高集会第七次集会决定修改《国防最高集会构造条例》，并送经中心常务会员会第七十次集会决定通过。6月又经中心常务委员会第八十一次集会修改,《国防最高集会构造条例》共10条。条例规定，国防最高集会为天下国防最高决定构造，对中心履行委员会政治委员会卖力.
2、军政部
1938年1月将原大本营第六部、军事委员会政训处、练习总监部政训处归并建立为政治部；1月任命陈诚为部长，2月正式建立。同时任命周恩来、黄琪翔为副部长，是年7月黄琪翔调任军训部副部长，张厉生接任副部长。
1938年1月军事委员会对所属停止改组．将百姓当局练习总监部改成军训部。2月16日任命白崇禧为部长。3月1日任命刘土毅、陈担当为次长。7月16日陈担当调任中心军校教诲长．调黄琪翔接任次长该部掌天下陆军练习、清算、校阅；军事黉舍教诲扶植改进；百姓兵教诲打算、校阅.
1937年12月13日南京沦亡后．百姓当局迁至武汉；1938年1月17日军事委员会又停止改组，将党政军分开。《修改军事
交通司司长王景禄。抗日战役发作后，因为交通停业日趋沉重，连续增设汽车、燃料、经理3个科.
1938年2月9日免唐生智总监职，以鹿钟麟任之.是年6月14日鹿钟麟他调，以何成浚任总监。1940年12月秦德纯代理副监，1942年10月实任。1941年1月免除谷正伦副监职，贺国光继任副监。