1937年7月抗日战役发作，9月8日军事委员会为整肃军纪，组建军法履行总监部，特派唐生智为总监；9月16日派谷正伦、王懋功为副监。
第二部该部于1937年8月20日建立、掌政略。8月20日任命张群为部长：9月11日张他调，任命熊式辉为部长、周佛海、卢作孚为副部长。11月16日该部归并于国度总动员设想委员会。
1938年1月17日为适应抗战的需求，军事参议院由直隶于百姓当局改成隶隶于军事委员会，为军事研讨及建议构造.
育、卫生2个科及统计室。1937年9月张建调任军医黉舍教诲长，胡兰生接任署长。
交通司司长王景禄。抗日战役发作后，因为交通停业日趋沉重，连续增设汽车、燃料、经理3个科.
军法履行总监部，掌理军队规律之保持与军法履行事件.该部下分总务、审判和督察3个组：总务组，掌理该部文电收发．承办文书典守印信、编审预算及经费出纳并碎务和官兵起落开补功过、奖惩告假旷职等各项事项。审判组，并军政部军法司而建立，掌甲士犯法案件考核事项；非甲士犯汉奸、烟毒、盗匪、贪污及其他法律应归军法审判案件之审理、考核事项；关于军法法规检查事项；关于解答法律疑问事项；关于军事犯措置事项；关于该组禁闭人犯收管、戒保护生登记、访问查抄册本函件各事项；关于军法行政事项。督察组，掌前火线文武构造职员违背军事法律之事项；关于考查各级司令部军法处有无枉纵事项；关于消查各地汉奸活动加以制裁事项；关于考查军情战况、交通运输、防空保镳、救保护生及公众构造练习各事项.
大本营对于作战指导，以达成“耐久战”为大旨，是以将军令、政略、财务、经济、鼓吹、练习划为6个部，分担负务，各应本大旨，适切应用，紧密联络，俾获最后之胜利，为共同分歧最高之原则.
2、大本营
1937年7月抗日战役发作,gmd于8月11日停止中心政治委员会第五十一次集会，集会为谋在作战期间同一批示党政军统统事项，将原设立的国防集会及国防委员会归并，设立国防最高集会，同时将原国防集会撤消.
3、大本营所属各部
第四部该部于1937年8月20日建立，掌国防经济：任命吴鼎昌为部长，何廉、黄季陆为副部长。1938年1月该部归并于经济部及有关各部。
2、军政部
1937年8月11日gmd中心政治委员会第五十一次集会决定通过了《国防最高集会构造条例》，并送经gmd中心常务委员会第五十次集会决定通过.1937年11月中心常务委员会决定．将中心政治委员会之权柄暂行停止，由国防最高集会代行国防最高集会应设在军事委员会委员长地点地.1938年2月23日国防最高集会第七次集会决定修改《国防最高集会构造条例》，并送经中心常务会员会第七十次集会决定通过。6月又经中心常务委员会第八十一次集会修改,《国防最高集会构造条例》共10条。条例规定，国防最高集会为天下国防最高决定构造，对中心履行委员会政治委员会卖力.