忽必烈在安定了内哄以后，又开端停止了对南宋的战役，决计同一天下。
公元1260年农历三月一日，忽必烈达到开平，在众将领和部分蒙古贵族的帮忙下，抢先宣布登上了王位。
当时，阿里不哥占有较着的上风，他驻守和林，有节制蒙古本土的便当。在蒙哥身后，他一面以监国身份为蒙哥举哀发丧，一边调将布兵，以阻防忽必烈。他先命脱里赤为断事官，占有燕京，号令四方；又命玉木忽儿带领东路雄师，出和林、越漠北，谋取开平；再命阿兰答儿带领西路军，下河西走廊，诡计与屯守在六盘山的浑都海部汇合，以构成对忽必烈的包抄情势。当时的关中地区最为庞大。蒙哥身后，他所带领的伐宋主力，退回到六盘山屯守，与本来驻守军队浑都海部汇合。阿里不哥期近位前就任刘承平、霍鲁怀到陕西任职，诡计节制陕川。这两小我都是忽必烈的死仇家，如果驻守在六盘山的这支劲旅悍然打击京兆，秦、陇、陕、蜀之地将尽为阿里不哥统统，对忽必烈构成致命的威胁。
按照蒙古国的风俗，担当汗位，必须在蒙前人的发源地停止，必须有各系宗王插手，才算合法。而忽必烈在开平担当汗位，是有违蒙前人的传统风俗的。是以，他的行动引发了很多贵族诸王的不满。特别是早在忽必烈南征未归时，其皇弟阿里不哥就已经拉拢一些人在策划篡夺王位。当阿里不哥听到忽必烈自主为王今后，也于1260年农历蒲月在阿尔泰山的驻夏之所，宣布担当王位，与忽必烈相对抗，从而引发了长达四年多的内哄。
忽必烈即王位后，起首采纳的军事办法就是先派廉希宪、商挺为京兆等路宣抚使，安抚关中。当他们得知刘承平、霍鲁怀前来联络六盘山驻军，图谋反叛时，便采纳决然办法，将此二人杀死。忽必烈遂令陕西、四川宣抚使八椿节制诸军，又令汪惟良征集秦陇、平凉等地军队，加强关中防务，周到监督六盘山军队。值得忽必烈光荣的是六盘山驻军不但没有乘势直捣京兆，反而因久驻思归，竟沿河西走廊北撤，这就大大和缓了关中的局势，使廉希宪有机遇调军队抓紧设防。北撤雄师到甘州后，碰上阿里不哥调派的阿兰答儿部，两军汇合后，除一部分持续北撤外，大部分又折回南进。达到甘肃山丹县后，阿里不哥的军队恰好同八椿、汪惟良部相遇，两边展开苦战。成果阿里不哥所属的军队大败，阿兰答儿、浑都海前后被杀。忽必烈得知环境后，当即带领军队亲征阿里不哥的驻地和林。阿里不哥闻讯流亡谦州，忽必烈在第一阶段的比武中终究占有了上风。
通过这些汉儒幕僚的帮忙，忽必烈对中国前代王朝的治乱兴衰有了充分的体味。忽必烈不但本身尽力接管、学习汉文明，还要其他蒙古贵族跟着学。他的儿子真金太子从小就跟姚枢、窦默学习《孝经》；当上中书左丞的阔阔，原为忽必烈在“潜邸”时的近侍，忽必烈让他拜王鹗为师，学习“治道”。
襄、樊是通向江南的大门，占有了襄、樊后，忽必烈兵分两路，一起从两淮方向打击，管束宋兵；一起从襄阳沿汉水而下，进入长江，直指南宋都城临安。公元1276年农历正月，在强大的蒙军面前，谢太后、宋恭宗赵只好投降了忽必烈。南宋随之灭亡。