冬十月丙子，停刑。乙酉，始射中官榷税通州。是后，各省皆设税使。群臣屡谏不听。
●■●隆庆二年，立为皇太子，时方六岁。性岐嶷，穆宗尝驰马宫中，谏曰：“陛下天下主，独骑而骋，宁无衔橛忧。”穆宗喜，上马劳之。陈皇后病居别宫，每晨随贵妃候起居。后闻履声辄喜，为强起。取经籍问之，无不响答，贵妃亦喜。由是两宫益和。
是年，暹罗、琉球入贡。
秋七月丁卯，吏部尚书孙丕扬请推补官员章疏，不报。戊寅，仁圣皇太后崩。乙酉，始遣中官开矿于畿内。未几，河南、山东、山西、浙江、陕西悉令开采，以中官领之。群臣屡谏不听。
■十三年春正月辛卯，四川建武所兵变，击伤总兵沈思学。
夏四月乙未，免湖广、四川逋赋。丙午，诏户部岁增金花银二十万两。
■十五年春正月壬辰，帑振山西、陕西、河南、山东诸宗室。
冬十月己未，侍郎王遴、吴百朋、汪道昆分阅边防。辛酉，停刑。
闰十仲春庚寅，诏罢来岁元夕灯火。
六月丁未，诸军进次宁夏，贼诱河套部入犯，官军击却之。
六月己酉，雷雨，西华门灾。敕修省。
玄月丁亥朔，日当食，阴云不见。己丑，停刑。
冬十月辛丑，汰表里冗官。乙巳，振苏、松、常、镇饥。
夏四月癸卯，倭弃王京遁。
六月庚辰，复遣内臣督苏、杭织造。
冬十月丙申，停刑。
是年，琉球入贡。
蒲月辛丑，穆宗神主祔太庙。
十仲春壬辰，寺人冯保谪奉御，籍其家。壬寅，复建言诸臣职。
夏四月，振江北、大名、开封诸府饥。
夏闰四月庚申，广西八寨贼平。
三月乙未，赐朱之蕃等进士落第、出身有差。
是年，振江北、湖广、河南、浙江、山东饥。河南矿贼大起。乌斯藏入贡。
六月辛亥，以云南用兵，免税粮及逋赋。
十仲春辛未，诏罢来岁元夕灯火。
玄月庚午，诏姑苏诸府开开荒田，六年后起科。辛未，停刑。
三月丙寅，大阅。是月，土蛮犯辽阳，副总兵曹簠御之，败绩。
玄月戊午，京师地动。
秋七月丁亥，初通漕运于密云。庚寅，察京官。己亥，戒谕廷臣，诏曰：“近岁以来，士习浇薄，官方刓缺，诋老成为无用，矜便佞为有才。遂使朝廷威福之柄，徒为人臣抨击之资。用是薄示惩戒，余皆曲贷。诸臣宜祓除前愆，共维新政。若溺于故习，背公秉公，开罪祖宗，朕不敢赦。”庚子，尊皇后曰仁圣皇太后，贵妃曰慈圣皇太后。
夏四月乙丑，潮、惠贼平。庚午，旱，谕百官修省。
玄月丙戌，奉两宫皇太后如天寿山谒陵。己丑，作寿宫。辛卯，还宫。
八月己巳，振山西灾。庚午，振淮、扬、徐水患。
冬十仲春丁卯，汰惜薪司内官冗员。是月，顺义王乞庆哈卒。
十仲春庚午，慈宁宫灾，敕修省。
秋八月丙子，礼部侍郎张四维为礼部尚书兼东阁大学士，预机务。丁丑，河决高邮、砀山。戊子，免淮、扬、凤、徐被水田租。
蒲月甲午，京师地动。
秋七月癸未，谕廷臣，国事纷繁，致大臣争欲乞身，而后有肆行诽谤者重治。
仲春戊寅，祀大社大稷。辛巳，诏南京职务清简，官不必备。丙申，始命日讲官分直记注起居，纂缉章奏，临朝侍班。