蒲月辛丑，穆宗神主祔太庙。
十仲春甲午，诏定戚臣庄田。癸丑，河套部敌犯榆林、延绥，总兵官杜桐败之。
夏四月丙寅，诏表里官行久任之法。
冬十月戊寅，振临洮被兵军民。
三月戊辰，宁夏致仕副总兵哱拜杀巡抚都御史党馨、副使石继芳，据城反。辛未，王家屏致仕。壬申，总督军务兵部尚书魏学曾讨宁夏贼。戊寅，赐翁正春等进士落第、出身有差。
夏四月丙午，大雩。戊申，以旱诏中外理冤抑，释凤阳轻犯及监禁年久罪宗。戊午，步祷于南郊，面谕大学士等曰：“天旱虽由朕不德，亦天下有司贪婪，剥害小民，乃至上干天和，此后宜慎选有司。”蠲天下被灾田租一年。
玄月甲申，如天寿山谒陵。己丑，还宫。
蒲月，四川建昌番反叛，讨平之。乙巳，以军储仓火及各省灾伤，敕表里官修省。
玄月丙戌，奉两宫皇太后如天寿山谒陵。己丑，作寿宫。辛卯，还宫。
冬十一月辛未，湖广灾，蠲振有差。
八月乙未，诏取太仓银二十万充阅陵赏费。
■十五年春正月壬辰，帑振山西、陕西、河南、山东诸宗室。
三月癸卯，诏修国史。夏四月己酉朔，日有食之。
■十八年春正月甲辰朔，召见大学士申时行即是毓德宫，出皇宗子见之。
十一月丙戌，振真定、顺德、广平灾，免税粮。
十仲春乙亥，陈于陛卒。
是年，安南、乌斯藏入贡。
六月己酉，雷雨，西华门灾。敕修省。
玄月丙辰，以皇宗子生，诏赦天下。甲子，上两宫皇太后徽号。
玄月己卯，起复张居正。
玄月壬申，许国致仕。甲戌，申时行致仕。丁丑，吏部侍郎赵志皋为礼部尚书，前礼部侍郎张位为吏部侍郎，并兼东阁大学士，预机务。
六月乙卯朔，日有食之。甲子，即天子位。以来岁为万历元年，诏赦天下。祀建文朝尽节诸臣于乡，有苗裔者恤录。庚午，罢高拱。丁丑，高仪卒。壬午，礼部尚书吕调阳兼文渊阁大学士，预机务。
秋八月丙辰，榜张居正罪于天下，家眷戍边。
玄月己未，停刑。庚申，如天寿山阅寿宫。甲子，次石景山观浑河。乙丑，还宫。庚午，甘肃兵变，巡抚都御史曹子登罢。是月，青海部长他不囊犯西宁，杀副将李魁。
夏闰四月庚申，广西八寨贼平。
■三年春正月丁未，享太庙。
六月庚申，京师地动。甲子，以灾伤停减苏、杭织造。
仲春乙丑，振广西饥。
●■●万历元年春仲春癸丑，御经筵。
夏四月丁巳，张四维以忧去。己未，吏部侍郎许国为礼部尚书兼东阁大学士，预机务。甲戌，承天大雨，江溢。是月，广东罗定兵变。
■十六年春三月壬辰，诏改《景天子实录》，去郕戾王号，不果行。山西、陕西、河南及南畿、浙江并大饥疫。
三月甲寅，礼部尚书马自强兼文渊阁大学士，吏部侍郎申时行兼东阁大学士，预机务。甲子，张居正葬父归。
是年，乌斯藏入贡。
蒲月辛卯，礼部尚书陈于陛、南京礼部尚书沈一贯并兼东阁大学士，预机务。庚子，王锡爵致仕。
闰仲春甲子，俺答子乞庆哈袭封顺义王。缅甸寇永昌。乙丑，如天寿山谒九陵，免所过田租。庚午，如西山谒恭让章皇后、景天子陵。辛未，还宫。乙酉，振临、巩、平、延、庆五府水灾，免田租。