■十八年春正月甲辰朔，召见大学士申时行即是毓德宫，出皇宗子见之。
蒲月丙戌，雨。
六月壬申，振淮安水患。
秋七月丁卯，吏部尚书孙丕扬请推补官员章疏，不报。戊寅，仁圣皇太后崩。乙酉，始遣中官开矿于畿内。未几，河南、山东、山西、浙江、陕西悉令开采，以中官领之。群臣屡谏不听。
蒲月庚子，淮、扬大水，诏察二府有司，贪酷老疾者罢之。
十一月己卯朔，日有食之。
■八年春仲春辛未朔，日有食之。戊子，耕耤田。戊戌，河工成。
秋七月丙申，河套部长失兔犯延绥。是月，延绥总兵官麻贵败河套部敌于上马关。
三月庚申，杭州兵变，执巡抚吴善言。丁卯，兵部侍郎张佳胤巡抚浙江，讨定之。丙子，泰宁卫部长把亥犯义州，李成梁击斩之。己卯，倭寇温州。
八月乙巳，兵部右侍郎宋应昌经略备倭军务。己酉，诏天下督抚举将材。
是夏，苏、松、常、镇大水。
秋七月乙卯，吕调阳致仕。丙子，诏江北诸府民，年十五以上无田者，官给牛一头、田五十亩开垦，三年后起科。
蒲月庚申，免先师孔子及宋儒硃熹、李侗、罗从彦、蔡沈、胡安国、游酢、真德秀、刘子翚，故大学士杨荣后嗣赋役有差。庚辰，振畿内饥。
十仲春己未，振辽东饥。
冬十月乙巳，以论张居正夺情，杖编修吴中行、检验赵用贤、员外郎艾穆、主事沈思孝，免除谪戍有差。丁未，杖进士邹元标，戍边。
秋七月癸酉，免陕西逋赋。甲戌，副总兵祖承训帅师援朝鲜，与倭战于平壤，败绩。甲申，罢三边总督魏学曾，以叶兰梦代之，寻逮学曾下狱。
八月庚申，以灾沴频繁，敕抚、按官惩贪吏，理冤狱，蠲租、振恤。
夏蒲月癸亥，祀地于北郊。
仲春甲寅，振四川被寇诸县。
夏四月丁酉，振山西被灾州县。乙卯，振苏、松、淮、凤、徐、宿灾。户部进《万历管帐录》。
冬十月己亥，土蛮犯广宁、义州，李成梁御却之。
夏四月己亥，李宗城自倭营奔还王京。
■十年春仲春癸巳，顺义王俺答卒。丁酉，免天下积年逋赋。
夏四月甲辰，总兵官李如松提督陕西讨贼军务。甲寅，甘肃巡抚都御史叶兰梦帅师会魏学曾讨贼。撦力克擒贼，叩关献俘，复还二年市赏。
十仲春甲午，诏定戚臣庄田。癸丑，河套部敌犯榆林、延绥，总兵官杜桐败之。
■二十一年春正月甲戌，李如松攻倭于平壤，克之。辛未，王锡爵还朝。辛巳，诏并封三皇子为王，廷臣力图，寻报罢。壬午，李如松打击王京，遇倭于碧蹄馆，败绩。
三月乙亥，乾清、坤宁两宫灾，敕修省。壬辰，下诏自责。是月，火落赤犯洮河，总兵官刘綎破走之。
八月丙戌，以灾异敕戒表里诸臣修举实政。
十一月戊子，郧阳兵噪，巡抚都御史李材罢。
秋七月丁亥，初通漕运于密云。庚寅，察京官。己亥，戒谕廷臣，诏曰：“近岁以来，士习浇薄，官方刓缺，诋老成为无用，矜便佞为有才。遂使朝廷威福之柄，徒为人臣抨击之资。用是薄示惩戒，余皆曲贷。诸臣宜祓除前愆，共维新政。若溺于故习，背公秉公，开罪祖宗，朕不敢赦。”庚子，尊皇后曰仁圣皇太后，贵妃曰慈圣皇太后。