中心释迦牟尼佛，主管中心娑婆天下，他有两位胁侍，“大智”文殊菩萨和“大行”普贤菩萨，号称华严三圣；他是这个天下的教养者，是佛教教主。他的法身是藏传佛教崇拜的大日如来。
法身是万法的本体，报身和化身则是法身所闪现的边幅和感化。体、相、用三位一体，法、报、化不即不离，总不出这一念心的范围。
此中元始天尊，别名“玉清元始天尊”。在“三清”当中位为最尊，也称原始天王，神仙中的第一名尊神。他是玄门开天辟地之神，为上古盘古氏尊谓，称玉清元始天尊，也称原始天王。元始天尊生于浑沌之前，太无之先，元气之始，故名“元始”。位于三清当中。灵宝天尊，玄门最高神灵“三清”尊神之一，又称通天教主。原称上狷介圣太上玉晨元皇大道君。齐梁高道陶弘景编定的《真灵位业图》列其在第二神阶当中位，仅次于第一神阶中位之元始天尊。唐朝时曾称为太上大道君，宋朝起才称为灵宝天尊或灵宝君。
小说《封神演义》中，把三清说成是鸿钧道祖的门徒，以太上老君（品德天尊）为长，元始天尊次之，通天教主（灵宝天尊）最小。乃是小说家言。
报身佛（卢舍那佛）颠末修习获得佛果，享有佛国（净土）之身。
西方阿弥陀佛，主管西方极乐天下，他有两位胁侍，“大勇”局势至菩萨和“大悲”观世音菩萨，号称西方三圣。普通祷告於阿弥陀佛，首要目标在於祈求身后的摆脱。汉传佛教以为，阿弥陀佛主如果以其愿力，引渡众生到极乐天下，离开磨难的循环，故亦号“接引佛”，也因为此佛有无量寿命与光亮，亦称“无量寿佛”、“无量光佛”。在藏传佛教，他被称为月巴墨佛，也是长命的象徵。
佛殿中三身佛的配置环境以下：中尊是法身佛毗卢遮那佛，左尊为报身佛卢舍那佛，右尊为应身佛释迦牟尼佛。
如此可猜想多宝道人便是厥后的释迦牟尼，即如来佛。而本就有多宝如来这个说法，可见多宝是老君选中，安排为中心佛界的治世之尊。但这是初级奥妙，孔宣并不晓得。他见辈分较低的新人多宝竟和两位老教主并世为尊，心中不爽，欲强替仆人出头。
品德天尊，即太上老君，玄门天神、教主。为三清之第三位。又称“品德天尊”、“混元老君”、“出世天尊”、“太清大帝”等。在玄门宫观“三清殿”，其泥像居右位，手执扇子。相传其本相为老子。
法身佛（毗卢遮那佛）代表佛教真谛（佛法）凝集所成的佛身。
玄门最高神灵“三清”别离是元始天尊，灵宝天尊和品德天尊。
这三位天尊，在玄门的较大宫殿中都有神像，叫“三清神像”。元始天尊居中，灵宝天尊居左，品德天尊居右。元始天尊左手虚拈，右手虚捧，意味六合未形，万物未生浑沌状况时的“无极”；灵宝天尊双手捧一半黑半白的圆形“阴阳镜”，意味从“无极”状况衍生出来的“太极”；品德天尊手拿一把画有阴阳镜的扇子，意味由“太极”分化出的六合“两仪”（或阴阳“两仪”）。合起来，恰是一幅玄门的宇宙图式，反应了玄门的宇宙观。
1、三世佛
三世佛，是大乘佛教的首要崇拜工具，俗称“三宝佛”。按照印度哲学，时候和空间是混合的，是以三世佛分为以空间计算的“横三世佛”与以时候计算的“纵三世佛”。