是以，人类效仿第十五颗生命之果的事件，从莉莉丝体内提炼出了聪明因子（因为没有聪明树，以是只是因子，肉*体需求野生培养），并孕育出了绫波丽，一样也用生命之果和聪明之果的技术培养出了eva，而作为祭品的就是碇真嗣的母亲碇唯，碇唯的身材成为了聪明因子的载体，终究产生了无数绫波丽，而碇唯的灵魂则进入了eva，代替了本来需求捐躯一全部种族才气凝集的种族认识（零号机直接就是莉莉丝的灵魂，二号机有明日香母亲的一部分灵魂，东治的三号机和设定本里有提到内里有东治他妈的灵魂）。
然后，人类找到了能量用尽的亚当，并持续抽取它的能量，终究迫使其退化到胚胎状况以保持生命，最后乃至被人类封印在树脂当中。
不但因为如此，因为亚当的白之月已经悬浮于地球卫星轨道上，莉莉丝对引力的计算产生偏差，导致黑之月登录失利，就这么直接撞进了地球里。
【提及来亚当和莉莉丝的行动形式与终究胡想中的杰诺瓦细胞非常近似，只不过杰诺瓦细胞停止宇宙观光是为了汲取星球的生命能量，亚当是为了获得更强的身材，而莉莉丝则是为了更强的聪明。】
但是莉莉丝来临地球时分散出去的聪明因子已经开端阐扬感化，渐渐退化出了人类，六千五百万年后，人类在南极发明了假死状况的亚当，因为地球上统统生物都具有亚当的生命因子（亚当的生命因子加强的是全部星球的退化速率，但只要退化的最强的生物在灭尽后才气变成生命之果），激发了亚当的复苏，形成了第二次打击，但戋戋一支科考队的人类的生命因子并不敷以完整重生亚当，亚当只能难堪的处于“灵魂保卫放了一波大，成果发明目标血量还没本身多”的难堪场面。
不过莉莉丝并没有任何的踌躇，在登岸后就立即开启了“转生打算”，通过黑之月上的聪明之树，将本身的聪明因子洒向大地，催生了不以精神力量取胜，而是靠着聪明立于食品链顶端的生命――人类，从某种意义上说，莉莉丝确切是这个天下统统人类的母亲没错了。
正所谓一山不能容二虎，除非一公和一母，但亚当与莉莉丝固然名字上看起来是一男一女，但实际上却并没有性别这一观点，因为它们本身就是一种靠近长生的类神生命体，完整依靠生命之树与聪明之树播撒遗传因子让本身达生长生，底子不需求通过两性生殖来繁衍后代。
不过这时候，人类的劣根性便发作了出来，魂之座（SEELE）每一个都想要成为人类补完打算的主体，因而培养搭载s2构造的量产机，攻击了NERV，不过碇原堂毕竟技高一筹，早在这之前就已经将亚当的胚胎植入了本身的右手（漫画里是吃下去然后呈现在左手），借由亚当胚胎和本身与绫波丽的干系，理所当然会成为最后的主体，只要如许，才气够达成碇源堂内心深处的阿谁欲望――与碇唯重新见面。
因为聪明之树被毁，莉莉丝有力回收聪明之果，在无法之下将本身的生命因子和已经结成的生命之果停止置换（也就是想要将这些使徒体内的亚当细胞转化成本身的细胞，同时也将生命之果中的一部分生命因子异化，如许才气够让本身和生命之果具有联络，从而在将来获得这份肉*体【这也是厥后为甚么使徒会把莉莉丝当作亚当的启事】，这个过程要持续千百万年，直到异化结束生命之果才气孵化），并存放于天下各地，本身则进入冰层甜睡，一边养伤一边等候生命之果孵化，诡计东山复兴。