崇祯二年（1629年），驻守宁远的来自于川、湖等地的兵士因为军饷的事而叛变，袁崇焕用计将其安定。而后袁崇焕要求将宁远、锦州合为一镇，让祖大寿镇守锦州，何可刚替代朱梅驻宁远，赵率教守关门，袁崇焕自驻宁远，同时上书给朱由检死力奖饰祖大寿等三人的才气，并说本身五年复辽的打算端赖这三人来实现，如果五年后没有实现，他将亲手将这三人斩杀，本身到司法部分领罪服死。朱由检加封袁崇焕为太子太保，并赐给蟒衣银币。[28]
被称为明末清初五大学者之一的朱舜水插手过“反清复明”的活动，在他的著作《朱舜水集》里，将袁崇焕称为“卖民贼”，[62]明末将领徐石麒也以为，袁崇焕大要上主战，而实际上是想主和，乃至以擒杀毛文龙的体例取信于清廷。[63]清朝学士张廷玉在撰写《明史》时以为袁崇焕杀毛文龙是“妄杀”，计六奇在《明季北略》里以为袁崇焕固然死的冤，但是他列十二条罪行杀毛文龙，如同秦桧以十二道金牌杀岳飞一样。[64]
清乾隆天子感觉袁崇焕的死值得怜悯，民国初年，梁启超在《袁崇焕传》中对袁崇焕大加赞美，以为他是能影响国度安危、民族兴亡的人。1952年，北京市停止大范围的改革都会扶植时，叶恭绰等联名上□□，要求庇护袁墓，□□在答复中称袁崇焕为“明末爱国魁首”。
下狱正法
袁崇焕的事迹、批评几百年来一向争辩不休，正如孟森在《明本兵梁廷栋请斩袁崇焕原疏附跋》中提及，明末期间汗青记录非常混乱，即便是与其耳目相干的人，其恩仇纠葛也特别庞大。此中，首要争议的集合点是袁崇焕杀死毛文龙、是否叛变明朝当局等。
杀毛文龙
袁崇焕接着说几件毛文龙违法做的事，毛文龙与其辩论，袁崇焕厉声斥责毛文龙，命令将毛文龙的冠服去除并捆绑起来，毛文龙表示不平，袁崇焕因而列数毛文龙的十二条罪行，拿出尚方宝剑，将毛文龙斩杀。[32]