洪承畴把全军三十多万人分为三个个人，以西路军为打击箭头，以中路军共同佯攻，借以管束明军，而东路军，则以死守属地为主。
南京故宫，虽已年久失修，又被粉碎，还是一座极其庞大宏伟的修建群，内为宫城，外为皇城，在宫城前建有端门、承天门和金水桥，构成一个T字型广场，广场东侧为五部办公地（刑部除外），西侧则为五军都督府。
顺治五年，尼堪又同英亲王阿济格一起安定天津一带的土寇，顺治六年，又被任命为定西大将军，讨伐叛将姜瓖，被晋封为敬谨亲王，不久却因为包庇阿济格擅自藏匿兵器而不报，被降为郡王。
清军入关的时候，尼堪在与李自成的大顺军作战中立下了不小的军功，击败李自成安定河南以后，尼堪又跟班豫亲王多铎南下攻打南明弘光政权，很快攻破了南京，率军追击并且抓获逃到芜湖的明福王朱由崧，随后又率军攻打江阴。
这位敬谨郡王尼堪，但是个大有来头的人物，他是清太祖努尔哈赤之孙，本是亲王，清初理政三王之一。
顺治三年，尼堪又随豪格入陕，打击汉中和四川，弹压张献忠部叛逆兵，在西充斩杀了张献忠，与贝子满达海分兵安定了四川。
自此，南京成为了当时中国的政治、经济、文明中间，明初时人丁约有七十万，到明朝中叶，人丁更高达一百二十余万，是当时中国范围最大、人丁最多的都会，也是全天下最大最繁华的都会，修造用时达二十七年的南京明城墙，是天下第一大城垣。
待邻近的各级首要将领到达南京后，洪承畴与众将商讨了一番，明白了计谋假想，下达了作战摆设令，并三令五申尽量减少劫夺，严禁再次屠城。
1644年仲春，李自成急攻北京，有人建议明思宗朱由检迁都南京暂避，朱由检因对众臣绝望而心灰意冷决意就义，同年蒲月福王朱由崧被四镇拥立于南京，改元弘光，建立了第一个南明政权。
虽说麾下众将中好几位都是坐镇一方的诸王大吏，爵位远高于他，但因洪承畴手握上方宝剑，众王爷倒是很给他面子，纷繁领命拜别。
终明一朝，南京一向是南边乃至天下的政治、经济和文明中间，不但北京一地统统吃穿用度均由此地筹集起运，乃至郑和七下西洋，都是以此地为起点。
若果能如此，那么，届时仰仗兵力的上风，便能把戋戋数千精锐明军淹没，为此，哪怕东路临时节节败退丢掉一些地盘，也在所不吝。
洪承畴很谨慎，不敢入宫居住，因而挑选了五军都督府，作为本身的批示部。
次年，清军兵临江南，攻陷南京后改南京为江宁，将南直隶地区改称为江南省，明故宫改成八旗驻防城，设置将军及都统二衙门于明故宫中，使明故宫修建群遭到了很大粉碎。
后在拜候北京以后，他将北京和南京作了一番比较：“此一都会之范围，其房舍之安插打算，其大众修建物之布局，以及其防备工事等，均远逊于南京。”
而东路军，则仍由平南王尚可喜任主帅，麾下共有广东驻军五六万人，另有三四万人驻守闽浙一带，以戍守为主。
秦淮河两岸集市云集，人流如织，经济繁华常常伴跟着文明的发财，诗词、书画都开一代之风。
江阴全城百姓因抵抗剃发令，在抗清三公的带领下抖擞抵挡，独守孤城八十一天，在二十多万清军携两百多门重炮围攻的环境下，杀死了清军三个王爷，十八名大将，共击毙清兵七万五千余人，史称“江阴八十一日”，后全城近十万百姓全数殉节，无一人投降，仅五十三人躲在寺观塔上保全了性命。