当时有个叫胡铨的官员反对“媾和”，并上奏章乞斩秦桧之头，就恰是在秦桧挟金人之势以要君的阶段所奏进的。他当即遭到秦桧的打击，由秦桧亲身制定，把他贬往“昭州（今广西平乐县）编管”。他因“妾孕临月”，想稍迟数日启程，成果被临安府“遣人械送贬所”。几天今后，秦桧还感觉对胡铨的处罚太轻，一定能使反对“媾和”的人今后钳口不言，遂又勒迫赵构特地下了一道诏令，说胡铨的上疏是“肆为凶悖”，“导倡凌犯之风”，戒谕中外，不准效尤。（均见《建炎以来系年要录》卷一二四。）
清圣祖康熙帝对宋高宗和秦桧“偏安社稷”的政策赐与了必定，而否定了“良将”岳飞、韩世忠、吴玠等抗金名将的做法。他的《御制文集》第三集卷十九有《宋高宗父母之仇毕生不雪论》中说：
诏狱本以纠大奸慝，故其事不常见。……（绍兴）十一年，枢密使张俊令人诬张宪，谓收岳飞笔墨，谋为变。秦桧欲乘此诛飞，命万俟卨熬炼成之。飞赐死，诛其子云及宪于市。……
绍兴二十五年(1155年)，秦桧病重，他晓得本身将不久于人间，便抓紧策划让其子秦熺继丞相位。秦熺仰仗秦桧的权势，先成为科举榜眼，接着一起高升，6年之间就官至枢密院事，职位仅次于秦桧。高宗之以是容忍秦桧，是因为他另有操纵的代价，现在秦桧将死，高宗当然不肯意看到另一个权相来威胁本身。十月，高宗亲临秦府探病，病榻旁的秦熺迫不及待地问：“由谁代任宰相之职？”高宗冷冷地答道：“这件事不是你应当问的！”这即是明白回绝了秦熺担当相位的要求，秦桧父子的快意算盘落了空。次日，秦桧、其子秦熺、其孙秦埙和秦堪被一起免官。得知高宗的旨意，秦桧当夜一命呜呼。
秦桧的书法存世有《偈语帖》、《深心帖》等，南宋曾宏父《凤墅帖》亦收录有秦桧的墨迹。
闻名武侠小说家梁羽生在《笔花六照》中指出，“秦桧的‘南人归南，北人归北’是‘两其中国’论调的祖宗”。
秦桧身后不久，在赵构所公布的一道诏令中，对秦桧的擅生杀之权的事也已经加以揭穿了。据《建炎以来系年要录》卷一七○，绍兴二十五年十仲春甲申(1156年1月5日)载：
锋芒直指宋高宗，揭穿了他出于本身的用心，勾搭秦桧殛毙岳飞的脸孔。这是很对的。从秦桧的始终来看，高宗与他两人，恰好是相互操纵的干系，一个为保本身的皇位，一个为求本身及其后代的繁华繁华。高宗在不需求秦桧的时候，顿时丢弃了昔日的火伴。在高宗与秦桧的干系中，高宗的感化是不成低估的，秦桧也只能是巴结高宗的企图来把持朝政的。在鄙弃秦桧的时候，千万不成忽视躲在他背后的君主独裁最高代表——宋高宗。