“至于洪翰林之语，是否已及大逆之事，臣觉得不然。皇上，洪翰林言语确切狠恶，可所针对之事，乃是边将无功、督抚黑钱不能尽除诸事，此中深意，实在是但愿皇上另择良将，彻查黑钱。并没有说因为眼下文武百官，多有不敷之处，以是这大清江山，就要颠覆了啊？至于洪翰林最后先仿宪皇，再仿仁皇之言，若不是仁皇宪皇体制足称，皆有圣治，他又为何要如此出言呢？是以臣觉得，洪翰林言语固然有过激之处，却绝非大逆，更不是犯上之语，望皇上三思。”说罢，阮元也再次拜倒，连续三叩，以示至诚。
“阮元，这吴省兰你也识得的，固然常日亲拥戴珅不假，但并无营私纳贿、滥用私家之事，也没有轻陷其他大臣之举。故而朕网开一面，不予夺职，只降了做六品闲职，放了学政，朕想着也没甚么不对啊？”嘉庆道。
“皇上，臣感觉不会如此。”阮元道：“川楚百姓，何故抵挡朝廷，皇上也对臣说过，百姓当中，均深知此举，乃是 官 逼 民 反。彼时没有洪翰林上言，可百姓还是反了。但皇上亲政以来，在四川重用刘清刘知府，他前后劝谕贼人归降，予以耕具东西，令其归家还耕，前后大半年来，已招安了两万人，这申明甚么？如果百姓晓得，皇上是至心为了他们着想，天然就不会抵挡朝廷，行贼盗之事了。如此看来，即便洪翰林这篇文章，有朝一日真的公之于天下，只要皇上至心体恤民情，今后用人恰当，百姓只会信赖所见皇上之仁政，倒是不会被险恶之人所传闻之事误导的。”
“皇上，臣觉得毫不至于如此，天下百姓能记得的，只要皇上的宽大。昔日苏订婚公上言宋仁宗，所言多坊间巷语之事，宋仁宗还是不予究查。莫非赵宋的江山，就如许被坊言巷语颠覆了不成？更何况皇上如果此时真诛杀了洪翰林，那于朝廷国法之上，只恐也说不畴昔了。”阮元所言苏订婚公指的是北宋的苏辙，他在制科测验中攻讦宋仁宗，所引之言经后代考据，多有不实，但宋仁宗仍然不予究查，这件事嘉庆自也晓得。
一则集思广益之法未备。尧、舜之主，亦必询四岳，询群牧。盖恐一人之聪明有限，必博收众采，庶无出事。……然寄耳目於摆布近习，不成也；询人之功过於其党类，亦不成也。盖人才至本日，销磨殆尽矣。以模棱为晓事，以软弱为良图，以追求为取进之阶，以轻易为服官之计。由此道者，无不各得其所欲而去，衣钵相承，牢结而不成解。……官方吏治，非所急也，保本任罢了。虑长远者，觉得过忧；事兴革者，觉得肇事。此又岂国度求治之本意乎？二则进贤退不肖似尚游移。夫邪教之起，由於激变。原任达州知州戴如煌，罪不容逭矣。……闻教匪甘心欲食其肉，知其地点，即死力焚劫。是以数月必移一处，教匪亦必随而迹之。近在川东与一道员联婚，恃以无恐。是救一有罪之人，反杀千百无罪之人，其理尚可恕乎？
而亮吉更有所虑者，前之所言，皆士大夫之不务名节者耳。幸有矫矫自好者，类皆惑於因果，遁入虚无，以蔬食为家规，以谈禅为国政。……及此回入都，而士大夫持斋戒杀又十居六七矣。深恐西晋祖尚玄虚之习复见於今，则所关世道民气非小也。何故言奖惩仍不严明也？自征苗匪、教匪以来，福康安、和琳、孙士毅则蒙蔽欺妄於前，宜绵、惠龄、福宁则丧师失律於后，又益以景安、秦承恩之因循畏葸，而川、陕、楚、豫之民，遭劫者不知几百万矣。……国法之宽，及诸臣之不畏国法，未有如本日之甚者。……今自乙卯以迄己未，首尾五年，偾事者屡矣。提、镇、副都统、偏裨之将，有一膺失律之诛者乎？而欲诸臣之不玩寇、不殃民得乎？