杨辅清出走后，石达开整备兵马，试图光复杨辅清先前占有的松溪、政和两地，稳固根本。1858年8月16日，石达开命令部众强攻松溪，松溪本地练勇却英勇非常，石达开攻城仅一日即放弃。
不到一个月，石达开在福建据点被清军一一断根，只余邵武孤城，四万雄师困于城中，上天无路，下地无门。
幸亏石达开偏师再度发威，霸占宁化，知府雷瑞光败逃。石达开尚未及移师宁化，清朝又一七品县令建立奇功，代理知县刘润田使部下团练冒充长毛，星夜赚开宁化城门，迎雷瑞光入城。
“只能杀出去了！”黄贵生说：“我们没有离开天国前，军士一个个舍生忘死，士气昂扬，粮食也充沛，又有安定的大片火线基地作依托，军心安宁，以是你能够用心批示兵戈，当然连打败仗。但是现在如何样呢？我们孤军作战，没有火线能够依托，没有其他的兵马能够共同作战，没有兵员弥补，没有粮食供应，转战千里，兵员越战越少，士气越来越低。翼王你纵有天大的本领，怎能差遣饿兵、疲兵去打比畴昔强大的湘军？何况我们步队中还异化了很多六合会的人马，规律很差，前天把多量步队拉走的花旗军首级林彩新就是此中一个。能希冀他们像我们老弟兄普通捐躯酬谢你的大恩吗？现在连本家弟兄镇吉都走了。”
石达开转攻政和，扎下营寨，为一字长蛇阵状，长二十余里，诡计阵容上赛过清军，当晚还命士卒添备火把，连夜决斗清军，清总兵池建功固执抵当，率部与石达开日夜苦战，但本来参与攻城的福建农夫叛逆兵因杨辅清拜别，不肯与石达开合作，纷繁撤走。
第二天，石达开的雄师撤出邵武城，冲破了清军的围攻，经闽赣鸿沟武夷山区的泰宁、宁化等县而达汀州府城长汀县。一起上山雨绵绵，山路泞滑，粮食完善，士卒饥困狼狈，怨声载道，除了战死以外，因饥饿而倒毙山径沟壑的也不时可见，军士离心的征象更加严峻了。石镇吉带领胞弟石镇常和部将曹广依等两万多人，仍然远远避开翼王，而自在活动在长汀东边的连城一带。
黄贵生到了石镇吉的大营，石镇吉不肯返来了，还劝黄贵生留下：“不是石某无情叛逆！翼王今非昔比，他没有容人之量！并且就凭现在的兵力，我们只能活行动战，打一枪换一个处所，而不能跟清妖抢杭州那样的多数会！并且支撑我们的公众都是乡间贫苦的百姓，我们去城里能做甚么？我已经劝过翼王数次，他就是不听。我只好单干了，道分歧不相为谋吧！”
曾国藩的军队刚到建昌，曾纪泽就带着一名衣衫褴褛、神采懊丧的年青人来投奔曾国藩，这个年青人，在安徽方才经历了数次军事上的惨败，幸运逃脱才没死，他就是汗青上大名鼎鼎的李鸿章！
石达开的部下开端悔怨误信其三寸不烂之舌，走上分裂线路的死路。杨辅清返回天京，仍然遭到重用，这给了他们很大鼓励，因而石达开的兵将开端大范围的出走：胡其相率多量精锐离开石达开，欲转入江西，却被湘军张运兰部截杀，无法投降，张运兰择胡其相部精干全数殛毙；杨再田与胡长佑、张运兰连日血战，不敌，遂离开石达开连夜遁逃；林彩新也率花旗军离开石达开；最为严峻的是，石军头号骁将石镇吉兄弟遭湘军围攻，伤亡惨痛，遂撤退至闽西南，自成一军，再不受石达开号令。