曾国藩还命周天受马不断蹄，率部日行百里，从衢州赶到浦城插手会战，福建巡抚庆端也派闽军精锐八百往援，又大发本地团练抄石达开后路，石达开退至城内，筹办耐久抵当，谁料守城才一日，城内百姓与清军郭启举相约里应外合，浦城沦陷。
杨辅清出走后，石达开整备兵马，试图光复杨辅清先前占有的松溪、政和两地，稳固根本。1858年8月16日，石达开命令部众强攻松溪，松溪本地练勇却英勇非常，石达开攻城仅一日即放弃。
与杨辅清结合的福建农夫叛逆兵固然撤走，但石达开仍有六七万人的气力，血战以后，必能破城，但石达开惯常捡漏的心机定势，使得日夜苦战后，功败垂成，因而命令各军清算辎重马匹，筹办窜回江西。
“不，现在不可了，湘军已有了防备，那条路走不通了。杨辅清出了铁牛关后，也碰上湘军。”石达开说道。
石达开站在城楼上，冷风吹来，慨叹起落毛凤凰不如鸡，他的原摆设曾都是天国骄兵悍将，这些老兵油子自蓄发跟随洪、杨，从金田到永安，再从永安到天京，向来只要他们杀得清妖狼奔豕突，无路可逃，现在却落入此等绝境：“天要亡我石达开吗？我不甘心！我不信命！我命不由天！”
石达开对周天培甚为轻视，主动反击，成果为清军前锋杀败，全军惊骇，疾走数十里，石达开连杀部下数十人，承平军的崩溃仍不能止。次日，石达开再度构造反击，周天培率清军主力迎战，石达开又为所破，偏将数人被杀，清军攻至距石达开老巢十里处。
石达高兴灰意冷，第二天放弃长汀，超出大隘岭，乘虚攻占八十里外的江西瑞金县城，十一月尾霸占了赣粤鸿沟的南安府，和四周的南康、崇义县城，将行营设在南安府北的池口镇，此时南有石镇吉的兵马在攻打广东境内的南雄县城，东有重新归队的花旗军林彩新围攻信丰县城，管束了清军的兵力，石达开乘机在南安休整士马，松了一口气，筹办安度春节。
不久，前去传令的承宣官从连城返来对石达开说：“国宗不肯返来，说是此身固然在外，却不敢涓滴叛变翼王，反可管束妖兵为殿下一臂之助。在连城国宗虎帐中，贵生兄弟也在那边，他也不返来了。”
幸亏石达开偏师再度发威，霸占宁化，知府雷瑞光败逃。石达开尚未及移师宁化，清朝又一七品县令建立奇功，代理知县刘润田使部下团练冒充长毛，星夜赚开宁化城门，迎雷瑞光入城。
石达开在长汀驻兵数日，命外甥黄贵生带人去呼唤镇吉归队，“本王念他兄弟一场，不肯意兵戎相见，他如果不归队，休怪本王无情！”
石达开的外甥黄贵生劝他回江西去：“我们还是回到江西去吧，杨辅清不是转移胜利，到了景德镇了吗？不要踌躇了，也走铁牛关这条线路北上吧。”
不到一个月，石达开在福建据点被清军一一断根，只余邵武孤城，四万雄师困于城中，上天无路，下地无门。
1858年，这一年石达开混得太差，厄运到临，他在浙江疆场遭受惨败，靠石镇吉等人拼力血战方幸运逃出浙江，达到福建又靠杨辅清打下的按照地才勉强居住。但石达开不但未存感激之情，反而因天王洪秀全的诽谤而妒恨石镇吉、杨辅清，意欲篡夺他们的兵权，导致杨辅清率部杀往江西，返回天京，石镇吉也心生了去意。