曾纪泽的华人武装占据婆罗洲后，面对不再是陆地上的威胁，而是来自海上的打劫，除了列强水兵，另有各种海盗，曾纪泽孔殷需求对华人武装力量停止整编鼎新，因而他策划了《婆罗洲军事力量扶植》指导计划：建立曾纪泽为首的军事批示机构，包含总参谋部、军事谍报部、后勤设备部、大汉军事学院等，并慢慢完美各部分机构。建立陆海作战兵种体制，根据当前实际环境，建立陆军、水兵两大首要作战力量，陆军包含步兵、炮兵、马队、通信兵、工程兵等兵种，水兵岸防兵、陆战队等兵种，曾纪泽还建立了特种军队，属于最高带领人曾纪泽亲身批示，由陆海兵员中提拔军事本质最优良、最虔诚的兵员构成，四百人，由苏慕白担负特种兵批示官。
不过，大汉国的水兵团体气力较弱。不过幸亏当时本钱主义国度推行自在贸易，国度没有军事限售一说，有黄金白银不但能买到兵舰，整支舰队都能买到。一些当局常常做一些卖老舰买新舰的买卖，借其他国度急需之际，高价出让本国的现成兵舰，比如英国就曾想卖给大清国阿思本舰队：阿思本舰队计有中级兵轮三艘，小级兵轮四艘，造舰兵器总经费计八十万两，舰队有七艘在英国购买的兵舰，由英国水兵上校舍纳德・阿思本为司令，船上六百名军官及海员俱在英国招募。舰队1863年开到天津，但因为舰队的司令和清当局对批示权、用人及破钞等各方面皆呈现严峻分歧，终究两边消弭合约，这支舰队闭幕，各兵舰由阿思本带回伦敦拍卖。
水兵部八千人，曾纪泽直接批示，组建三个港口炮台，岸防兵员1500人，大型千吨级蒸汽兵舰除了“龙腾号”，在爪哇海战中俘虏的荷兰主力舰也被改革成“龙兴”号，还用五六百吨的商船改革了十来艘炮舰。
射击练习为练习一百米站卧蹲三姿精度射击，军事学院水兵分院多了泅水的科目。
炮兵战术练习包含：条约战术原则、炮兵战役根基原则、战役批示、战役保障，攻防作战中炮兵战役行动和专业兵之间、兵种之间的协同练习。
曾纪泽还在岛上建立预备役体制，预备役兵一万人，确保作战兵员及时弥补，本来兰芳国就是全民皆兵的轨制，这一点并不困难。
战术练习包含：单兵战术有卧倒、持枪卧倒、端枪卧到、活动姿式为低姿蒲伏、高姿蒲伏、侧身蒲伏，高姿侧身蒲伏、滚进等；个人战术解除阵列对射战术，采取利用的散兵作战小组制，每三至五报酬一个战役小组，分离反击相互共同，打击时以班排为最小作战单位，顺次保护、瓜代反击、梯子配置，减少被射击面积，降落伤亡率。
很快，大汉国的华人，就达到上百万人，曾纪泽命令免费分给到婆罗洲的华人必然的地盘和丛林，让他们安家。
军事力量大大加强后，曾纪泽决定在大汉国建立专门的移民部，从广东和江浙一带多量运移民到婆罗洲，这时候英法联军占据了广州，抓了两广总督叶名琛，清当局有力节制本地老百姓，加上承平天国的战乱，本地百姓民不聊生，很多人传闻大汉国华人职位高，都情愿出海餬口。