六月二旬日，松茂番被安定。这年夏天，施助直隶、河南、陕西及广西浔、柳、平乐，广东琼山等十二县饥荒。山西始闹盗贼。
十一月二十六日，施助真定、顺德、广平灾害，免除税粮。当年，淘汰各省冗官，查对徭役赋税，淘汰诸司冒滥冗费。有琉球、安南、土鲁番、天方、撒马儿罕、鲁迷、哈密、乌斯藏前来朝贡。
三月初九，被夺职和升迁的官员上朝面谢。今后今后天子临御逐步减少。十六日，云南永昌生兵变。十八日，赐焦..等人以进士落第和其他不称出身。
蒲月初五，诏令表里官员慎重停止刑狱之事。
玄月月朔，应有日蚀，但因阴云讳饰而不能瞥见。初三，中断行刑。
冬十月初三，京师再次地动，命群臣修身检验。初四，中断行刑。
十一月初十，下诏测量百姓地步。
八月十四日，朱翊钧诏令从太仓取银二十万两充作阅陵的犒赏用度。
十仲春八日，布告天下：宁夏贼寇已被安定。
三月二十五日，诏令订正国史。
十一月十三日，河工完成。
秋七月月朔，诏谕救济朝鲜的各边镇军队返回。初三，呈现彗星，命群臣修身检验。
■
十一月十六日，余有丁死去。
玄月二十二日，又诏谕姑苏诸府开开荒田，六年以后起科。二十三日，中断行刑。
十仲春初七，朱翊钧又诏谕免除第二年元夕灯火。
六月，施助福建饥荒。
夏四月，京师大旱，瘟疫风行。
蒲月，大清太祖高天子起兵挞伐尼堪外兰，霸占图伦城。
六月初六，以云南用兵为由，免除税粮及拖欠赋役。
六月初二，雷雨交集，西华门罹难，诏令修身检验。
秋七月，江北生蝗灾，江南生水患，山西、陕西、河南、山东又生水灾，黄河也在开封决口，朝廷别离赐与减免赋税和施助。
十仲春十三日，陈于陛死去。
秋七月初八，施助苏、松水患，免除其税粮。十四日，京师生地动。
秋八月初八，黄河又在崔镇决口。闰八月月朔，日蚀，因阴云而未见。
三月初八，宁夏已去官的副总兵口孛拜殛毙巡抚都御史党馨、副使石继芳，占有城池背叛。十一日，王家屏去官。十二日，总督军务的兵部尚书魏学曾领兵讨伐宁夏叛贼。十八日，朱翊钧赐赉翁正春等人以进士落第及其他分歧的出身。
仲春初四，皇宗子朱常洛出阁讲学。十六日，派官员施助河南，并免除其田租。
秋玄月初九，青海部长永邵卜进犯甘肃，参将达云将其击败。十六日，下诏规复建文年号。
玄月月朔，王家屏因父丧离职。二十四日，中断行刑。二十八日，朝廷下帑并派官吏施助河南、山东、直隶、陕西、辽东、淮、凤灾害。
仲春十七日，免除兖、青、登、莱所辖地区的拖欠赋税。十九日，册立王氏为皇后。
夏蒲月初六，广东罗旁瑶被安定。
三月初三，因为久旱，要廷臣疏陈时政。初八，制止部曹言事，放弃整治京畿水田。十八日，赐赉唐文献等报酬进士落第以及其他分歧的出身。二十三日，仍然久旱不雨，朱翊钧又命天下修身检验。
夏四月初五，停止昌大祈雨祭奠。初七，因为久旱不雨，朱翊钧诏令各地审理、昭雪冤案，开释凤阳轻犯以及监禁长时候的罪犯。十七日，又步行至南郊祷告，对大学士们说：“天大旱，是因为朕不德，也是因为各地有司贪婪，剥削百姓，导致天怒，此后必须慎选官吏。”免除天下受灾地区一年田租。