三月初二追削张居正的官级。十八日，赐赉朱鼎祚等报酬进士落第和其他分歧的出身。
■万历六年(1578)春正月，朝廷征集民工构筑黄河缺口堤岸。
夏四月二十三日，王家屏重新入阁。始兴妖僧李圆朗反叛，进犯南雄，被有司率兵讨伐并斩死。
冬十月初九，中断行刑。二十九日，完成黄河决口筑堤工程。
闰三月十二日，朱翊钧以呈现彗星为由，命群臣修身检验。十四日，责备给事中、御史擅进调侃天子之言，罚减其官俸一年。
八月十四日，朱翊钧诏令从太仓取银二十万两充作阅陵的犒赏用度。
夏四月初五，停止昌大祈雨祭奠。初七，因为久旱不雨，朱翊钧诏令各地审理、昭雪冤案，开释凤阳轻犯以及监禁长时候的罪犯。十七日，又步行至南郊祷告，对大学士们说：“天大旱，是因为朕不德，也是因为各地有司贪婪，剥削百姓，导致天怒，此后必须慎选官吏。”免除天下受灾地区一年田租。
十一月十三日，河工完成。
当年，琉球前来朝贡。
冬十月十三日，审理犯人。二十六日，上朝办公判阅选官轨制。
■万历十六年(1588)春三月初十，朱翊钧下诏点窜《景天子实录》，删去成阝戾王之封号，厥后没有实施。山西、陕西、河南及南畿、浙江同时生饥荒和瘟疫。
冬十月初三，京师再次地动，命群臣修身检验。初四，中断行刑。
三月初三，因为久旱，要廷臣疏陈时政。初八，制止部曹言事，放弃整治京畿水田。十八日，赐赉唐文献等报酬进士落第以及其他分歧的出身。二十三日，仍然久旱不雨，朱翊钧又命天下修身检验。
这年，有琉球前来朝贡。
■万历二十三年(1595)春正月癸卯日，朝廷调派都督佥事李宗城、批示杨方亨封平秀吉为日本国王。
冬十月初五，大学士申时行奏请天子唆使转留在宫禁中的各种奏章。
这一年，京师生蝗灾，南畿、浙江生水患，朝廷别离予以施助和减免赋税。同年，琉球前来朝贡。
冬十月十四日，施助徐州及丰、沛、睢宁、金乡、鱼台、单、曹七县水患，免除分歧数量的田租。
六月月朔，日蚀。初十，朱翊钧担当天子之位。定第二年为万历元年，颁诏大赦天下。在乡间祭奠建文朝尽节诸臣，有子孙后代的加以恤录。十六日，夺职高拱。二十三日，高仪死去。二十八日，礼部尚书吕调阳兼任文渊阁大学士，参与秘密事件。
夏四月十四日，免除湖广、四川所欠的赋税。二十五日，朱翊钧诏谕户部每年增收金花银二十万两。
三月十六日，诏令表里官员保举将材。
六月十四日，朱翊钧诏令天下各地每年夏季审判犯人，对轻犯之类予以弛刑和开释，以两京为例。二旬日，倭使小西飞朴拙要求投降。
十一月二十六日，施助真定、顺德、广平灾害，免除税粮。当年，淘汰各省冗官，查对徭役赋税，淘汰诸司冒滥冗费。有琉球、安南、土鲁番、天方、撒马儿罕、鲁迷、哈密、乌斯藏前来朝贡。
三月初八，宁夏已去官的副总兵口孛拜殛毙巡抚都御史党馨、副使石继芳，占有城池背叛。十一日，王家屏去官。十二日，总督军务的兵部尚书魏学曾领兵讨伐宁夏叛贼。十八日，朱翊钧赐赉翁正春等人以进士落第及其他分歧的出身。