夏四月乙丑，潮、惠贼平。庚午，旱，谕百官修省。
六月戊辰，浙江海溢。戊寅，命抚、按官，有司贤否一体荐劾，不得侧重甲科。
■二十二年春正月己亥，诏以各省灾伤，山东、河南、徐、淮尤甚，盗贼四起，有司玩愒，朝廷诏令不可。自今以安民弭盗为抚按有司黜陟。
■三年春正月丁未，享太庙。
六月壬子，王锡爵归省。
■六年蒲月，穆宗崩。
■七年春正月戊辰，诏毁天下书院。
玄月壬申，宁夏贼平。
十仲春辛酉，振榆林、延绥饥。甲戌，以大行未期，罢来岁元夕灯火及宫中宴。
蒲月甲午，京师地动。
是年，琉球入贡。
八月乙巳，兵部右侍郎宋应昌经略备倭军务。己酉，诏天下督抚举将材。
六月，振福建饥。
冬十月己亥，土蛮犯广宁、义州，李成梁御却之。
冬十月庚申，大学士申时行请留中章奏。
夏蒲月癸亥，祀地于北郊。
■十九年春正月，顷甸寇永昌、腾越。
玄月庚午，诏姑苏诸府开开荒田，六年后起科。辛未，停刑。
夏四月丁酉，振山西被灾州县。乙卯，振苏、松、淮、凤、徐、宿灾。户部进《万历管帐录》。
十仲春庚午，慈宁宫灾，敕修省。
蒲月，倭犯朝鲜，陷王京，朝鲜王李〈口公〉奔义州求救。
十仲春乙亥，陈于陛卒。
十一月癸丑，以星变考查百官。
仲春癸丑，皇宗子常洛出阁讲学。甲子，遣使振河南，免田租。
冬十月甲寅，决囚。丁卯，视朝阅铨选。
六月丁未，诸军进次宁夏，贼诱河套部入犯，官军击却之。
闰仲春甲子，俺答子乞庆哈袭封顺义王。缅甸寇永昌。乙丑，如天寿山谒九陵，免所过田租。庚午，如西山谒恭让章皇后、景天子陵。辛未，还宫。乙酉，振临、巩、平、延、庆五府水灾，免田租。
是年，琉球入贡。
■二十一年春正月甲戌，李如松攻倭于平壤，克之。辛未，王锡爵还朝。辛巳，诏并封三皇子为王，廷臣力图，寻报罢。壬午，李如松打击王京，遇倭于碧蹄馆，败绩。
蒲月庚申，免先师孔子及宋儒硃熹、李侗、罗从彦、蔡沈、胡安国、游酢、真德秀、刘子翚，故大学士杨荣后嗣赋役有差。庚辰，振畿内饥。
秋七月丁酉，谕吏、户二部清吏治，蠲逋赋有差，来岁漕粮折收十之三。壬寅，遣御史督修江、浙水利。甲辰，修泗州祖陵。辛亥，草湾河工成。
六月乙未，张居正还京师。
仲春己丑，遣使分阅边防。
三月乙巳，赐沈懋学等进士落第、出身有差。
●■●隆庆二年，立为皇太子，时方六岁。性岐嶷，穆宗尝驰马宫中，谏曰：“陛下天下主，独骑而骋，宁无衔橛忧。”穆宗喜，上马劳之。陈皇后病居别宫，每晨随贵妃候起居。后闻履声辄喜，为强起。取经籍问之，无不响答，贵妃亦喜。由是两宫益和。
仲春戊戌，免兗、青、登、莱所属逋赋。庚子，立皇后王氏。
三月戊戌，以旱霾，谕廷臣陈时政。癸卯，禁部曹言事，罢治京畿水田。癸丑，赐唐文献等进士落第、出身有差。戊午，久旱，敕修省。
■十四年春仲春癸未，严外官馈遗。
夏四月癸卯，倭弃王京遁。