黄初元年（220年），曹丕代汉称帝，程昱复为卫尉，进封安乡侯，增邑三百户，并前共有八百户。分封少子程延及孙程晓为列侯。朝廷正欲以程昱为三公，程昱却在此时归天，曹丕亦为之流涕，追赠车骑将军，谥曰肃侯，寿八十。
曹操征徐州时，程昱与荀彧留守火线，阻吕布、陈宫雄师，保住三城，因功受封
为东平相，屯于范县。曹操将汉献帝迁往许都后，任命程昱为尚书，后又为东中郎将，领济阴太守，都督兖州事件。讨平袁谭、袁尚后，拜为奋武将军，封安国亭侯。
程昱生性刚戾，与人多有反面。有人诬告程昱谋反，而曹操却对其赐待益厚。
建安十六年（211年），曹操征讨韩遂、马超时，曹丕留守，又使程昱参知军事。等时田银、苏伯即是河间作反，曹丕遣将军贾信征讨。叛军中有千余人请降，朝中大臣皆以为应遵还是法，尽诛降军，程昱却说：“之前之以是要诛杀投降者，是因为当时势势动乱，天下大乱，攻打贼人时采纳‘围而后降者不赦’的目标，目标在于向别的乱党显现不尽早投降的结果，让统统仇敌都感到惊骇，未围先降，那今后用兵便不需求动辄围城。现在天下情势大抵已经安宁，并且今次的战事是产生在国土以内，这些都是不成气候的贼众，杀了他们也没有能够请愿示惧的处所，落空了以往诛降的战略意义。是以我以为这些降兵不成诛杀；即便要诛杀他们，也要先扣问曹公的定见。”但是当时的大臣都说：“军事方面我们能够自行下决定，毋须事事向曹公启奏啊！”程昱闻言后，不再作出回应。
曹操没有军粮的时候拿人肉给曹操供应军粮，是个狠角色。
程昱又遣别骑占住仓亭津，陈宫军不能得渡。程昱至东阿时，东阿令枣祗已经率吏民拒城死守。又有兖州处置薛悌与程昱协谋，终究守住三城，以待曹操。曹操偿还，执程昱之手道：“若非程卿之力，吾无所归矣。”因而表程昱为东平相，屯于范县。
建安十八年（213年），魏国建立时，程昱为卫尉，因与中尉邢贞争威仪，遭到夺职。
攻取荆州后，中原之地大抵安定，曹军权势逐步扩大。一次，曹操抚着程昱之背说道：“当初兖州之败，若非服从你的战略，我又怎能够来到这里呢？”程昱答道：“所谓‘满足不辱’（出自《品德经》第四十四章，指一小我只要晓得满足，就不会因为过份的贪婪而获得屈辱的结束），现在是我激流涌退的时候了。”因而正式表示今后缴还兵权，阖门不出。
兴平元年（194年），曹操与吕布在濮阳交兵，数度得胜。又有蝗虫灾害，因而两边引兵暂去。袁绍因而令人游说曹操连和，但愿曹操能搬家于邺城。当时曹操目睹兖州新失，军粮又将尽，计议之下正想承诺袁绍要求。程昱见事，向曹操言道：“窃闻将军想遣居迁邺，与袁绍连和，有如许的事吗？”曹操说：“是的。”程昱劝谏：“我以为将军您只是一时临事而惧，不然又怎会如此不沉思熟虑？袁绍占有燕、赵之地，怀兼并天下之心，但是其智不能济其事。将军自发得能在他底下做事吗？将军您有龙虎之威，能够做韩（信）、彭（越）他们如许臣服于别人的事吗？现在兖州虽残，另有三城可守。能战之士，不下万人。以将军的神武，加上我和文若（荀彧字）等人的帮手，并收城池兵士而加以应用，那么霸王之业能够成绩了。但愿将军能慎重考虑一下！”曹操才放弃连和袁绍的设法。