三公
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大司马
司空领宗正、少府、司农三卿。司空属吏有长史一人、掾属二十九人、令史及御属四十二人。
汉光武帝即位，置大司徒官，卖力群众教养，掌礼节诸事。与太尉、司空共同会商天子交议的国政，定议后会衔上奏。
汉光武帝即位，置大司马官，卖力天下军官的考核，每岁末，评定等次，上奏天子，作为军官升迁、降调的根据，当时有大司马吴汉。
司徒领太仆、鸿胪、廷尉三卿。属吏有长史一人，秩千石。掾属三十一人。
司空
建武二十七年（公元51年），去“大”，称司徒。
东汉将洛阳以外的地区分别为十二个州，各遣刺史一报酬长官。另以京兆、左冯翊、右扶风、河东、河南、河内、弘农七郡为司隶校尉辖区，称司隶部（汉朝州也称部）。
汉武帝废太尉设大司马，加于大将军、骠骑将军、车骑将军、卫将军之上。东汉光武帝又废大司马为太尉，为掌管军政和军赋的最高官职，即天下最高军事长官。东汉时太尉与司徒、司空并称三公。东汉光武帝刘秀时减弱三公的权力，厥后三公几近无实权只是名誉的意味。东汉末年，三公（太尉、司徒、司空）已成为虚职，在三公以外另设大司马，大司马和大将军均位在三公之上，如刘虞、权臣李傕。三国期间，各国在三公以外另设大司马，普通由大将军升迁而来。如：魏国的大司马曹仁、曹休、曹真；蜀汉的的大司马蒋琬；吴国设有大司马和左大司马、右大司马，普通由大将军或者上大将军升迁而来，如丁奉、吕岱、陆抗、施绩、朱然。
按东汉轨制，三公掌谋议国之大政。太尉的首要参政路子就是与司徒、司空共同会商天子交议的国政，定议后会衔上奏。东汉一朝，仅见牟融、徐防以太尉录尚书事，与太傅参决政事。这申明太尉除非被任命为录尚书事，并没有决定政务的权柄。
按东汉以三公领九卿的轨制，太尉领太常、卫尉、光禄勋三卿。太尉府属吏有：长史一人，秩千石，总管各曹事件。各曹掾、史、属共二十四人。在诸曹中，西曹卖力太尉府官吏的任免；东曹卖力二千石的迁调；户曹卖力户籍、祭奠、农桑；奏曹卖力奏议；辞曹卖力审理案件，接管上诉；法曹卖力驿站事件；尉曹卖力士卒和犯人的征调、运输事件；贼曹卖力缉拿盗贼；决曹卖力讯断刑法；兵曹卖力军事事件；金曹卖力货币与盐铁事件；仓曹卖力国度堆栈事件。别的，另有黄阁，主簿，是中间诸吏的长官。另有令史及御属二十三人，中间令史卖力太尉的仪仗执事；记室令史卖力太尉府的奏章等各种文书的办理；门令史卖力太尉府门卫。其他令史分隶诸曹，办理文书事件。从东汉太尉府诸曹的设置以及职掌来看，太尉的统领范围仿佛非常广，但那都是名义上的东西，太尉诸曹所领事件，或受制于尚书台，或仅仅为文牍来往，本身并没有可否之权，并且太尉对本府诸曹事件并没有实际节制的权力。
汉魏期间，有军功者比比皆是，授予官职的难度加大。是以常在“将军”前冠以某个名号以作为他的官职，这类名号并无必然，名号之间也无上下级干系，是以称为杂号将军。临事设置，事毕即撤。如骁骑、楼船、材官、伏波、贰师、度辽、龙骧等，或以所领军队（如骁骑、材官），或因推行的任务（如李广利攻贰师城）。唯度辽将军因南匈奴所部时有内哄，自永平八年（65年）后常设。汉末今后，开端呈现四征、四镇、四平、四安等重号将军。