公元996年，阿齐兹归天，其子艾卜・阿里・曼苏尔・哈基木（公元996―1021年）以十一岁继位。他在位期间杀大臣，毁圣陵教堂等基督教堂，轻视基督徒和犹太人。厥后，哈基木自称真主化身，一个新教派奉之，即为德鲁兹教派，此派尚行于黎巴嫩。
赛义德（公元909～934在位）即位后，在政治上与巴格达的阿拔斯王朝相对抗。在宗教上，奉什叶派伊斯玛仪派为国教，在聚礼日祷告词中为阿里和哈里发祝贺，遂成为伊斯玛仪派的宗教魁首。赛义德东征西战，对内弹压艾布・阿卜杜拉的背叛，对外将版图扩大至阿尔及利亚、摩洛哥、利比亚及西西里岛，为法蒂玛王朝奠定了根本。公元934年赛义德殁后，其继任者仍推行向外扩大政策。
在宗教上，伊斯兰教获得进一步传播和生长。王朝在各地修建了大量清真寺，均附设宗讲授校，派出布道师和法官到各地传播什叶派教义、教法，主持宗教事件，哈里发命令在各地清真寺聚礼日为阿里和哈里发祝贺，并严禁喝酒、音乐和文娱，在经、训研讨上，夸大其隐义，并按什叶派观点阐佛教义和教法，构成巴颓尼叶派(内学派)，在王朝末期从伊斯玛仪派平分化出阿萨辛派。对基督教及其他异教徒多采纳宽大政策。
王朝生长
公元1021年，哈基木被暗害，其子扎希尔继位（公元1021―1035年）年十六。与东罗马天子君士坦丁八世约，罗马天子许以东罗马境内各清真寺中提念哈里发名字，许重修君士坦丁堡清真寺，而哈里发许重修圣陵教堂。
公元1035年，麦阿德・穆斯坦绥尔（公元1035―1094年在位）以十一岁即位，其母为犹太人所卖犹太女奴，与该犹太人摄政。在位六十年，国势敏捷式微。公元1043年失叙利亚于塞尔柱突厥。北非西部、西西里岛亦失。所可道者，唯公元1058年，原巴格达将军白萨西里逼迫阿拔斯朝哈里发嘎义木把职位的各种意味（包含先知的大氅和别的遗物）转到开罗，各地穆斯林开端奉开罗哈里发为正宗。
法蒂玛王朝担当和生长了阿拉伯东方伊斯兰文明，嘉奖科学研讨，生长教诲奇迹，文明发财，学术繁华。公元972年在开罗建立爱资哈尔清真寺，并生长成宗教大学，天下各地门生来此肄业，人才辈出，成为伊斯兰教什叶派宗教及学术文明中间。哈里发阿齐兹在开罗建立了皇家图书馆，藏书达20万册，保藏有大量各种笔墨珍本，仅用金泥誊写的《古兰经》就达2400册。
公元1005年哈里发哈基姆为传授和鼓吹什叶派教义，弘扬伊斯兰学术文明，创办了科学馆(daral－hikmah)，延聘各地闻名学者停止学术研讨，其范畴包含宗教、哲学和天然科学的各学科。并附设黉舍、图书馆和天文台，其附设的黉舍专门培养什叶派宗讲授者和官吏，除宗教各学科外，还设有医学、天文学等。天文学家伊本・优努斯、光学家伊本・海赛姆等皆在此获得科学成绩。王朝文明名城开罗、凯鲁万、非斯与巴格达齐名。
王朝建立
公元1096～1144年间叙利亚和巴勒斯坦大部分属地前后被塞尔柱王朝和十字军占据。公元1071年，诺曼人占据西西里岛，并蚕食了非洲大陆一些地盘。十字军入侵埃及后，西亚赞吉王朝素丹**丁应法蒂玛王朝末代哈里发阿迪德之请，派部将希尔库及其侄子萨拉丁率军往援。公元1171年萨拉丁颠覆法蒂玛王朝哈里发阿迪德(公元1160～1171)，自主为苏丹，灭法蒂玛王朝，建立阿尤布王朝，今后在埃及规复了伊斯兰教逊尼派职位。