‘阿难！此是诸佛甚深所行，难可托解；汝今能受，当知皆是如来能力。阿难！统统声闻、独觉，及未登地诸菩萨等，皆悉不能照实信解，唯除平生所系菩萨。阿难！人身可贵；于三宝中，信敬尊敬，亦难可得；闻世尊药师琉璃光如来名号，复难因而’。
如是我闻：一时薄伽梵，游化诸国，至广严城，住噪音树下。【ㄨ】与大比丘众八千人俱，菩萨摩诃萨三万六千，及国王、大臣，婆罗门、居士，天龙八部，人非人等，无量大众，恭敬环绕，而为说法。
尔时、世尊，复告曼殊室刊孺子言：‘曼殊室利！有诸众生，不识善恶，惟怀贪吝，不知布施及施果报，愚痴无智，阙于信根，多聚财宝，勤加保护。见乞者来，其心不喜，设不获已而行施时，如割身肉，深生怜惜。复有无量坚贪有情，积集资财，于其本身尚不受用，何况能与父母、老婆、奴婢作使，及来乞者？彼诸有情，今后命毕生饿鬼界，或傍生趣。由古人间曾得暂闻药师琉璃光如来名故，今在恶趣，暂得忆念彼如来名，即于念时从彼处没，还生人中；得宿命念，畏恶趣苦，不乐欲乐，好行惠施，赞叹施者，统统统统悉无贪惜，渐次尚能以头子手足血肉成分施来求者，况余财物？’
‘第三大愿：愿我来世得菩提时。以无量无边聪明便利，令诸有情皆得无尽所受用物，莫令众生，有所乏少’。
尔时、阿难问救脱菩萨曰：‘善男人！应云何恭敬扶养彼世尊药师琉璃光如来？续命旛灯复云何造’？救脱菩萨言：‘大德！如有病人，欲脱病苦，当为其人，七日七夜受持八分斋戒。应以饮食及余资具。随力所办，扶养苾刍僧。日夜六时，礼拜行道，扶养彼世尊药师琉璃光如来。读诵此经四十九遍，然四十九灯；造彼如来形像七躯，一一像前各置七灯，一一灯量大如车轮，乃至四十九日光亮不断。造五色采旛，长四十九杰手，应放杂类众生至四十九。可得过分危厄之难，不为诸横恶鬼所持’。
‘复次、曼殊利室！若诸有情好喜乖离。更相斗讼，恼乱自他，以身语意，造作增加各种恶业，展转常为不饶益事，相互暗害。告召山林树冢等神；杀诸众生，取其血肉祭奠药叉、罗刹婆等；书怨人名，作其形像，以恶咒术而咒诅之；厌魅蛊道，咒起尸鬼，令断彼命，及坏其身。是诸有情，若得闻此药师琉璃光如来名号，彼诸恶事悉不能害，统统展转皆起慈心，好处安乐，无损恼意及嫌恨心，各各欢腾，于自所受生于喜足，不相侵凌互为饶益’。
‘阿难！彼药师琉璃光如来，无量菩萨行，无量善巧便利，无量泛博愿；我若一劫，若一劫余而广说者，劫可速尽，彼佛行愿，善巧便利无有尽也！’
尔时、世尊告阿难言：‘如我称扬彼世尊药师琉璃光如来统统功德，此是诸佛甚深行处，难可解了，汝为信不？’
佛告阿难：‘是诸有情若闻世尊药师琉璃光如来名号，诚意受持，不生迷惑，堕恶趣者无有是处’。
‘第四大愿：愿我来世得菩提时。若诸有情行正道者，悉令安住菩提道中；苦行声闻独觉乘者，皆以大乘而安立’。