‘世尊！有诸众生，信根不具，闻说诸佛甚深行处，作是思惟：云何但念药师琉璃光如来一佛名号，便获尔所功德胜利？由此不信，返生诽谤。彼于长夜失大利乐，堕诸恶趣，流转无穷！’
尔时、世尊，复告曼殊室刊孺子言：‘曼殊室利！有诸众生，不识善恶，惟怀贪吝，不知布施及施果报，愚痴无智，阙于信根，多聚财宝，勤加保护。见乞者来，其心不喜，设不获已而行施时，如割身肉，深生怜惜。复有无量坚贪有情，积集资财，于其本身尚不受用，何况能与父母、老婆、奴婢作使，及来乞者？彼诸有情，今后命毕生饿鬼界，或傍生趣。由古人间曾得暂闻药师琉璃光如来名故，今在恶趣，暂得忆念彼如来名，即于念时从彼处没，还生人中；得宿命念，畏恶趣苦，不乐欲乐，好行惠施，赞叹施者，统统统统悉无贪惜，渐次尚能以头子手足血肉成分施来求者，况余财物？’
‘第二大愿：愿我来世得菩提时，身如琉璃，表里明彻，净无瑕秽；光亮泛博，功德巍巍，身善安住，焰网寂静过于日月；幽冥众生，悉蒙开晓，随便所趣，作诸奇迹’。
‘或有是以，生于天上，虽生天上，而本善根，亦未穷尽，不复重生诸余恶趣。天上寿尽，还生人间，或为轮王，统摄四洲，威德安闲，安立无量百千有情于十善道；或生刹帝利、婆罗门、居士大师，多饶财宝，堆栈盈溢，形相端严，家属具足，聪明聪明，勇健威猛，如大力士。如果女人，得闻世尊药师琉璃光如来名号，诚意受持，于后不复更受女身’。
‘复次、阿难！彼琰魔王主领人间名籍之记，若诸有情，不孝五逆，破辱三宝，坏君臣法，毁于性戒，琰邪术王随罪轻重，考而罚之。是故我今劝诸有情，然灯造旛，放生修福，令度苦厄，不遭众难’。
尔时、阿难问救脱菩萨曰：‘善男人！应云何恭敬扶养彼世尊药师琉璃光如来？续命旛灯复云何造’？救脱菩萨言：‘大德！如有病人，欲脱病苦，当为其人，七日七夜受持八分斋戒。应以饮食及余资具。随力所办，扶养苾刍僧。日夜六时，礼拜行道，扶养彼世尊药师琉璃光如来。读诵此经四十九遍，然四十九灯；造彼如来形像七躯，一一像前各置七灯，一一灯量大如车轮，乃至四十九日光亮不断。造五色采旛，长四十九杰手，应放杂类众生至四十九。可得过分危厄之难，不为诸横恶鬼所持’。
‘第四大愿：愿我来世得菩提时。若诸有情行正道者，悉令安住菩提道中；苦行声闻独觉乘者，皆以大乘而安立’。
尔时、众中有十二药叉大将，俱在会坐，所谓：宫毗罗大将，伐折罗大将，迷企罗大将，安底罗大将，頞你罗大将，珊底罗大将，因达罗大将，波夷罗大将，摩虎罗大将，真达罗大将，招杜罗大将，毗羯魔大将：此十二药叉大将，一一各有七千药叉，觉得家属。