1937年7月7日抗日战役发作后，唐生智兼任军事委员会保镳履行部主任，9月8日百姓当局令大本营军事练习总监唐生智兼任军法履行总监。11月12日上海沦陷，日军直扑南京，蒋介石在会上扣问众将对戍守南京的观点，李宗仁和白崇禧参军事角度上均不主张恪守南京。蒋又问唐生智，唐则俄然起立，大声疾呼：“现在仇敌已逼近都城。都城是国父陵寝地点地，值此大敌当前，南京如不捐躯一二员大将，我们不特对不起总理在天之灵，更对不起我们的最高统帅。本人主张死守南京，和仇敌拼到底！”唐的一席大话，恰是大敌当前的危急之时，很有大义凛然的气势。蒋介石听罢唐言，大喜过望，当即委任唐为南都城防司令。唐更慨然受命，誓与南京共存亡。李宗仁当时感到唐大有张睢阳嚼齿流血之概，很不觉得然。李宗仁便如有讽刺地翘起大拇指，对唐说：“盂潇，你真了不起啊！”唐则反唇相讥：“德公，战事演变至此，我们还不肯干一下，也太对不起国度了！”，他劈面向蒋介石包管“临危稳定、临难不苟”，表示“没有统帅号令决不撤退，誓与南京共存亡”，19日蒋介石手令唐生智为南京卫戍司令长官，20日到职，24日百姓当局特派唐生智为南京卫戍司令长官，所辖军队十一个师加教诲总队共十一万，分核心阵地和复廓阵地两个梯次装备，决计一战。11月25日，日军分三路向南京进逼，12月5日核心战打响，7日日军向南京复廓阵地逼近，至9日战况更加狠恶，日军松井石根向卫戍司令长官唐生智奉劝交出南京，唐生智号令将各部统统船只尽数收缴，以作背水一战。
日军劝降不成，10日开端对南京总进犯，唐生智冒敌机轰炸批示中国守军对抗日军打击，对峙不进地下室，在百子亭寓所批示作战，11日全线展开苦战。11日晚蒋介石命唐生智乘机撤退，但唐未向城外军队下达撤退令，故城外军队不知撤退之事，一向苦战，当时死守雨花台中华门，失守后退，碰到宋希濂。宋希濂说唐生智有死号令，后退者杀无赦。李弥无法又杀归去。[2]12日敌猛攻南京光彩门、战役门，雨花台失守。下午唐生智命令撤退，肯定“大部渡江，一部突围”的原则，唐生智出城用预留的一艘汽艇渡江北逃，军队因无船渡江，原撤退打算未能实现，各军只得冬泳渡江，灭顶者不计其数，不会泅水的只好脱掉戎服混入百姓步队。13日日军入城掉队行了惨绝人寰的“南京大搏斗”，被惨杀者达三十万人，天下震惊，唐生智乘车抵滁州，后转汉口见蒋介石引咎辞职，并未置议。
因为军官不顾兵士的大逃窜，使十几万百姓党守军的士气顿时土崩崩溃，因而，兵士也大逃窜，绝大多兵士都往南京的下关跑，为甚么？因为兵士们晓得，那儿有他们军官们偷偷保存的船只！部下传闻本身的长官往下关去了，也就都跟畴昔了。就如许，数万百姓党军与成千上万的公众都涌向下关，但是，挹江门的36师却不放军队通过，因为他们接到号令，从下关撤退的只是卫戍长官部和36师。因而军队混作一团，厥后乃至产生了内部的枪战。在南京大搏斗中，有八万多中国战俘被日军搏斗，但没有任何一其中下级的百姓党军官战死。