1617年，西藏萨迦派僧侣沙尔呼图克图达到蒙古地区，寻觅本身的支撑者，林丹汗为沙尔呼图克图的神通所佩服，并封他为国师，并接管通俗密乘之灌顶，因而林丹汗由黄教改信红教（狭义上的红教仅指宁玛派，广义上包含了萨迦派和噶举派）。沙尔呼图克图为了获得林丹汗的信赖，从五台山取来元世祖时萨迦派八思巴喇嘛用令媛所铸的玛哈噶喇金佛（又称大黑天，为蒙元的护国神）。林丹汗在察汉浩特修建金顶白庙，将金佛供于此中。林丹汗试图效仿忽必烈与八思巴故事，操纵他与沙尔呼图克图之间的干系来建立本身的权威。但是适得其反，这减轻了信奉黄教的蒙古诸部的离心，减弱了林丹汗的号令力。
文明
此时，林丹汗与明朝的干系也在恶化中，他西迁的一个首要目标就是获得右翼所具有的“市赏”，但明崇祯帝即位，“尽革其赏”，林丹汗派去索赏的大臣贵英恰也被明军所杀。因此林丹汗于1628年六月大肆入侵大同，杀死明朝军民数万人，差点攻占大同城。[21]明朝本欲以右翼诸部抵抗林丹汗，但到1628年底时右翼地区被林丹汗安定，明朝不得不于次年规复“市赏”。固然如此，林丹汗仍于1631年和1632年侵犯明边。1631年十一月，林丹汗东征西拉木伦河，侵袭已降金的阿鲁科尔沁达赉楚琥尔牧地，带走了塞棱阿巴海的部众。皇太极亲率2000名精锐马队赶来，林丹汗早已撤走。别的，他还杀了漠北外喀尔喀诸部派到右翼的使者，引发漠北诸部的发急。[22]
后代降金
政治
1627年，林丹汗西迁，兼并右翼诸部（哈喇慎、土默特、鄂尔多斯、永谢布等），此中一个首要目标是获得明朝给右翼诸部的“市赏”。明朝不给林丹汗，林丹汗乃出兵进犯大同，明朝不得不规复对林丹汗的犒赏。后金操纵林丹汗西迁之机，兼并了察哈尔本部，并于1632年大肆打击林丹汗，林丹汗闻讯远遁青海。他与明朝的干系完整分裂，明朝乃至将林丹汗遗留的财物及部众移交给后金。厥后林丹汗与西藏藏巴汗、康区白利土司月顿多吉和喀尔喀绰克图台吉（却图汗）结成“反黄教联盟”，诡计东山复兴，但很快于1634年归天。
随后，林丹汗分开辽河套，踏上西迁之路。关于他西迁的启事，有以下几个：起首是因为他在右翼已众叛亲离，再加上后金兵锋正盛，被迫挑选西迁；其次是操纵右翼力量亏弱之机，兼并诸部，规复蒙古大汗的共主职位；第三是当时察哈尔部与明朝贸易的据点广宁已经沦陷，林丹汗想通过兼并右翼诸部以将明朝给右翼的丰富“市赏”据为己有。[18]1627年十月，林丹汗以察哈尔部八鄂托克之一的多罗特留守故地，率数万众西迁。[19]
交际
林丹汗在1612年与1615年攻打明朝，试图获得与明朝的贸易权，终究在1617年如愿以偿。1618年，后金侵明，林丹汗为了获得明朝的赏银，推行“联明抗金”的交际目标，并在1619年给□□哈赤写了一封言辞傲慢的国书，导致与后金反目。不过，林丹汗与明朝缔盟并未挡住后金对辽东的吞噬，1622年明朝在广宁之战得胜，林丹汗的救兵没起感化，而后二者间的联盟冷却下来。林丹汗也开端实施攘外必先安内（“先处里，后处外”）的政策，开端火并科尔沁、内喀尔喀诸部，并且制止与后金正面比武。以是林丹汗从未亲身与后金作战过。