早在母系氏族社会的旧石器期间，龟兹人已能用石器、骨器制造需求的出产、糊口器具，并且发明了弓箭。由母系氏族社会进入到新石器期间的父系氏族社会后，畜牧业有了长足的生长。从温宿县北部天山包孜东乡小库孜巴衣发明的岩画中，能够看到龟兹原始社会打猎、放牧及兽类被追逐的活泼画面。它位于龟兹天山北麓和静县哈尔莫敦乡察尔乎沟一号坟场，这里还出土了大量畜牧业器具、牲口骨骼和多量装奶用的带流嘴的陶器，有一件残陶罐上绘有一只骆驼。由对这些距今3 000～2 000年摆布的出土文物阐发来看，当时居住在这里的人群以畜牧业为主，同时还兼营农业、打猎和手产业。
东汉建初元年（76年）汉章帝初即位，恐班超单危不能自主，下诏征超。疏勒两城自超去后，复降龟兹。东汉建初三年（78年），班超率疏勒、康居、于阗、居弥兵一万人攻破姑墨石城，斩首七百级。班超欲是以叵平诸国，上疏请兵：“窃见先帝欲开西城，故北击匈奴，西使本国，鄯善、于阗立即向化。今拘弥、莎车、疏勒、月氏、乌孙、康居复愿归附，欲共并力幻灭龟兹，平通汉道。若得龟兹，则西域未服者百分之一耳……今西域诸国，自日之所入，莫不向化，大小欣欣，贡奉不断，惟焉耆，龟兹独未从命。臣前与官属三十六人奉使绝域，备遭艰厄。自孤守疏勒，于今五载，胡夷情数，臣颇识之。问其城郭大小，皆言“倚汉与依天等”。以是效之，则葱岭可通，葱岭公例龟兹可伐。今宜拜龟兹侍子白霸为其国王，以步骑数百送之，与诸国连兵，光阴之间，龟兹可禽。以蛮夷攻蛮夷，计之善者也。臣见莎车、疏勒地步肥广，草牧饶衍，不比敦煌、鄯善间也，兵可不费中国而粮食自足。且姑墨、温宿二王，特为龟兹所置，既非其种，更相厌苦，其必将有降反。若二国来降，则龟兹自破。愿下臣章，参考行事。”书奏，帝知其功可成，建初五年（80年），出兵千人就班超。
晋武帝太康中（285年），龟兹王遣子入侍。前秦建元十八年（382年)苻坚之大将吕光率兵七万伐龟兹，龟兹王白纯不降，吕光进军讨平龟兹。
11世纪末，回鹘的黑汗王朝改宗伊斯兰教，对西域诸佛国建议了旷日耐久的“圣战”。14世纪，改宗伊斯兰的察合台汗秃黑鲁帖木儿对龟兹的佛教教徒停止了残暴的毒害，对佛教文明停止了毁灭性的粉碎。佛教寺院古刹被拆毁，佛像被摧毁，佛教典范文献被燃烧，佛教教徒被搏斗，具有千余年汗青的龟兹佛教文明被粉碎殆尽。本地佛教僧侣或被迫接管伊斯兰教，或逃往异国他乡，或顺从被杀。
佛教很能够是最后由龟兹传入中国的。法国汉学家列维在《所谓吐火罗语b即龟兹语考》一文中指出据中国最早的2世纪佛经译本中的佛教用语如“沙门”、“沙弥”不能对比梵文的sramana、sramenera，但与龟兹语的samane、sanmir很近，由此鉴定中国2世纪佛经必然是从原始的龟兹语翻译而来，龟兹语作为佛经传入中国的谋介，约莫在公元一世纪。闻名的佛经翻译家如龟兹国师鸠摩罗什于401年到长安，构造译场翻译佛经。来自龟兹的高僧另有龟兹王世子帛延、帛尸梨蜜、帛法炬、佛图澄、莲华精进等。